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Enregistrement W2076188217 · doi:10.1074/jbc.m109.034884

The Clavesin Family, Neuron-specific Lipid- and Clathrin-binding Sec14 Proteins Regulating Lysosomal Morphology

2009· article· en· W2076188217 sur OpenAlexafffund
Yohei Katoh, Brigitte Ritter, Thomas Gaffry, F Blondeau, Stefan Höning, Peter S. McPherson

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCellular transport and secretion
Établissements canadiensMcGill UniversityMontreal Neurological Institute and Hospital
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésEndosomeClathrinCell biologySignal transducing adaptor proteinLysosomeGolgi apparatusBiologyVesicleClathrin adaptor proteinsChemistrySignal transductionBiochemistryMembrane

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Clathrin-coated vesicles (CCVs) originating from the trans-Golgi network (TGN) provide a major transport pathway from the secretory system to endosomes/lysosomes. Herein we describe paralogous Sec14 domain-bearing proteins, clavesin 1/CRALBPL and clavesin 2, identified through a proteomic analysis of CCVs. Clavesins are enriched on CCVs and form a complex with clathrin heavy chain (CHC) and adaptor protein-1, major coat components of TGN-derived CCVs. The proteins co-localize with markers of endosomes and the TGN as well as with CHC and adaptor protein-1. A membrane mimic assay using the Sec14 domain of clavesin 1 reveals phosphatidylinositol 3,5-bisphosphate as a specific lipid partner. Phosphatidylinositol 3,5-bisphosphate is localized to late endosomes/lysosomes, and interestingly, isoform-specific knockdown of clavesins in neurons using lentiviral delivery of interfering RNA leads to enlargement of a lysosome-associated membrane protein 1-positive membrane compartment with no obvious influence on the CCV machinery at the TGN. Since clavesins are expressed exclusively in neurons, this new protein family appears to provide a unique neuron-specific regulation of late endosome/lysosome morphology.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,228
Écart entre enseignants0,210 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations47
Publié2009
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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