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Enregistrement W2076211550 · doi:10.1042/bj20060579

Age-related accumulation of pentosidine in aggrecan and collagen from normal and degenerate human intervertebral discs

2006· article· en· W2076211550 sur OpenAlexaff
Sarit Sivan, Eve Tsitron, Ellen Wachtel, Peter J. Roughley, Nico Sakkee, Jeroen DeGroot, Alice Maroudas

Notice bibliographique

RevueBiochemical Journal · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAdvanced Glycation End Products research
Établissements canadiensShriners Hospitals for Children - Canada
Organismes subventionnairesEuropean Commission
Mots-clésPentosidineChemistryAdvanced glycation end-productAggrecanGlycationProteoglycanLysineGlycosaminoglycanInternal medicineEndocrinologyBiochemistryExtracellular matrixBiologyMedicineAmino acidOsteoarthritisPathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

During aging and degeneration, many changes occur in the structure and composition of human cartilaginous tissues, which include the accumulation of the AGE (advanced glycation end-product), pentosidine, in long-lived proteins. In the present study, we investigated the accumulation of pentosidine in constituents of the human IVD (intervertebral disc), i.e. collagen, aggrecan-derived PG (proteoglycan) (A1) and its fractions (A1D1-A1D6) in health and pathology. We found that, after maturity, pentosidine accumulates with age. Over the age range studied, a linear 6-fold increase was observed in pentosidine accumulation for A1 and collagen with respective rates of 0.12 and 0.66 nmol x (g of protein)(-1) x year(-1). Using previously reported protein turnover rate constants (k(T)) obtained from measurements of the D-isomer of aspartic residue in collagen and aggrecan of human IVD, we could calculate the pentosidine formation rate constants (k(F)) for these constituents [Sivan, Tsitron, Wachtel, Roughley, Sakkee, van der Ham, DeGroot, Roberts and Maroudas (2006) J. Biol. Chem. 281, 13009-13014; Tsitron (2006) MSc Thesis, Technion-Israel Institute of Technology, Haifa, Israel]. In spite of the comparable formation rate constants obtained for A1D1 and collagen [1.81+/-0.25 compared with 3.71+/-0.26 micromol of pentosidine x (mol of lysine)(-1) x year(-1) respectively], the higher pentosidine accumulation in collagen is consistent with its slower turnover (0.005 year(-1) compared with 0.134 year(-1) for A1D1). Pentosidine accumulation increased with decreasing buoyant density and decreasing turnover of the proteins from the most glycosaminoglycan-rich PG components (A1D1) to the least (A1D6), with respective k(F) values of 1.81+/-0.25 and 3.18+/-0.37 micromol of pentosidine.(mol of lysine)(-1) x year(-1). We concluded that protein turnover is an important determinant of pentosidine accumulation in aggrecan and collagen of human IVD, as was found for articular cartilage. Correlation of pentosidine accumulation with protein half-life in both normal and degenerate discs further supports this finding.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,043
Score d'incertitude au seuil0,331

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,026
Tête enseignante GPT0,326
Écart entre enseignants0,300 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations105
Publié2006
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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