Genetic Relatedness of Multidrug-Resistant, Methicillin (Oxacillin)-Resistant <i>Staphylococcus aureus</i> Bloodstream Isolates from SENTRY Antimicrobial Resistance Surveillance Centers Worldwide, 1998
Notice bibliographique
Résumé
We reviewed Staphylococcus aureus bloodstream infection isolates from SENTRY centers worldwide during 1998 to evaluate the molecular epidemiology of multiply drug-resistant methicillin (oxacillin)-resistant S. aureus (MDR-MRSA). MDR-MRSA was defined as a S. aureus isolate with a MIC for oxacillin at >2 microg/ml and with four or more additional resistances. A total of 325 unique patient isolates of MDR-MRSA from five continents were analyzed using ribotyping and pulsed-field gel electrophoresis (PFGE). The frequency of MDR-MRSA among all S. aureus BSI isolates ranged from only 2.2% in Canada to 35.6% in the Asia-Pacific region. Forty-eight ribotypes (RT) were distinguished, but over 80% of the isolates were contained within the 10 most prevalent RTs. The most common RT, RT 184.5, which included 30% of all MDR-MRSA, was found on four of five continents. PFGE provided superior discrimination and identified numerous clusters of possible clonal dissemination of MDR-MRSA within individual medical centers and between institutions that are in geographic proximity. In four instances, strains with indistinguishable PFGE patterns were found on more than one continent. The predominant PFGE subtype in South America (RT 893.5/Ia) was isolated from patients at centers in Brazil, Argentina, and Portugal, and closely related subtypes were isolated in Chile and Italy. There is great geographic variation in rates of methicillin- and multidrug-resistance among S. aureus bloodstream isolates worldwide. Although many MDR-MRSA strains group geographically, a few closely related epidemic strains have wide regional and even global range.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».