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Enregistrement W2076247704 · doi:10.1387/ijdb.062241mc

Embryonic heat shock reveals latent hsp90 translation in zebrafish (Danio rerio)

2007· article· en· W2076247704 sur OpenAlexafffund
Michelle H. Connolly, Brian K. Hall

Notice bibliographique

RevueThe International Journal of Developmental Biology · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueHeat shock proteins research
Établissements canadiensDalhousie University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaKillam Trusts
Mots-clésBiologyZebrafishSomitogenesisDanioHeat shock proteinCell biologyGeneticsHeat shockHsp90SomiteChaperone (clinical)PhenotypeTranscription factorGeneEmbryonic stem cell

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

There is increasing evidence that more genetic variation is present among metazoans than is normally expressed in the phenotype, due in part to the canalization of development. Among teleosts (as in other vertebrates), this genetic variation is often expressed as phenotypic change in response to environmental cues. Using embryonic zebrafish (Danio rerio), this 'hidden' variation is explored in the context of environmental stress by investigating the activity of heat shock protein-90 (HSP90), a cytosolic chaperone that interacts with transcription factors to mediate multiple developmental pathways. Following a 37 degrees C heat shock during early somitogenesis (1 hour heat shock, targeting 2-14 somite stages), phenotypic variability was expressed in the lower trunk and tail bud regions, where somite development was reduced or ceased prematurely. In situ hybridization showed that hsp90 was localized to this caudal region 16 hours after heat shock, indicating its potential to coordinate somitic fate. By following transcription and translation of this chaperone, we show that 24 hours following heat shock zebrafish embryos express a protein signature which reflects the RNA message. However, by 48 hours, message and protein are uncoupled; while endogenous gene expression is downregulated, heat-shocked embryos express a discrete segmented protein pattern within the trunk, suggesting regulation of transcription and of translation in response to environmental stress.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,069
Score d'incertitude au seuil0,349

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,313
Écart entre enseignants0,289 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations37
Publié2007
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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