Self-regulated Cleavage of the Mitochondrial Intramembrane-cleaving Protease PARL Yields Pβ, a Nuclear-targeted Peptide
Notice bibliographique
Résumé
Regulated intramembrane proteolysis (RIP) is an emerging paradigm in signal transduction. RIP is mediated by intramembrane-cleaving proteases (I-CliPs), which liberate biologically active nuclear or secreted domains from their membrane-tethered precursor proteins. The yeast Pcp1p/Rbd1p protein is a Rhomboid-like I-CliP that regulates mitochondrial membrane remodeling and fusion through cleavage of Mgm1p, a regulator of these essential activities. Although this ancient function is conserved in PARL (Presenilins-associated Rhomboid-like protein), the mammalian ortholog of Pcp1p/Rbd1p, the two proteins show a strong divergence at their N termini. However, the N terminus of PARL is significantly conserved among vertebrates, particularly among mammals, suggesting that this domain evolved a distinct but still unknown function. Here, we show that the cytosolic N-terminal domain of PARL is cleaved at positions 52-53 (alpha-site) and 77-78 (beta-site). Whereas alpha-cleavage is constitutive and removes the mitochondrial targeting sequence, beta-cleavage appears to be developmentally controlled and dependent on PARL I-CliP activity supplied in trans. The beta-cleavage of PARL liberates Pbeta, a nuclear targeted peptide whose sequence is conserved only in mammals. Thus, in addition to its evolutionarily conserved function in regulating mitochondrial dynamics, PARL might mediate a mammalian-specific, developmentally regulated mitochondria-to-nuclei signaling through regulated proteolysis of its N terminus and release of the Pbeta peptide.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».