MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2076514367 · doi:10.1074/jbc.m110.132142

Ischemia/Reperfusion Reduces Transcription Factor Sp1-mediated Cystathionine β-Synthase Expression in the Kidney

2010· article· en· W2076514367 sur OpenAlexaff
Nan Wu, Yaw L. Siow, O Karmin

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueFolate and B Vitamins Research
Établissements canadiensUniversity of ManitobaSt. Boniface Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCystathionine beta synthaseTranscription factorHomocystinuriaIschemiaKidneyTranscription (linguistics)Sp1 transcription factorBiologyChemistryCell biologyMedicineInternal medicineEnzymeGene expressionBiochemistryGenePromoterCysteine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Cystathionine beta-synthase (CBS) is a key enzyme that catalyzes the rate-limiting step for homocysteine (Hcy) metabolism via the trans-sulfuration pathway and is also responsible for the production of H(2)S through the desulfhydration reaction. Our recent studies demonstrate that renal ischemia/reperfusion decreased the CBS activity leading to Hcy accumulation and H(2)S reduction in the kidney, which in turn contributed to kidney injury. Both Hcy and H(2)S play important roles in physiological and pathological processes. In this study we investigated the molecular mechanism by which CBS activity was regulated in the kidney. The left kidney of Sprague-Dawley rat was subjected to 45 min of ischemia followed by 6 h of reperfusion. Ischemia/reperfusion caused a significant decrease in CBS mRNA and protein levels in the kidney. As a consequence, there was a marked reduction in the CBS enzyme activity. Transfection of kidney proximal tubular cells with transcription factor (Sp1) small interfering RNA caused a marked reduction in CBS mRNA, indicating a pivotal role for Sp1 in regulating CBS expression in kidney cells. Electrophoretic mobility shift assay and chromatin immunoprecipitation assay detected a lower Sp1 activity in kidneys subjected to ischemia/reperfusion as compared with that in a sham-operated group. ERK-mediated phosphorylation of Sp1 was responsible for a decreased transcriptional activity of Sp1 in the kidney upon ischemia/reperfusion. These results suggest that reduced kidney CBS gene expression during ischemia/reperfusion is mediated via a decrease in Sp1 transcriptional activity. Regulation of CBS-mediated Hcy and H(2)S homeostasis may offer a renal protective effect against ischemia/reperfusion injury.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,035
Tête enseignante GPT0,308
Écart entre enseignants0,272 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations59
Publié2010
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of Biological ChemistryMême sujetFolate and B Vitamins ResearchTravaux en français237 207