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Enregistrement W2076527015 · doi:10.1111/j.1365-2052.2007.01674.x

The effect of a c.‐8G&gt;T polymorphism on the expression of <i>cytochrome b5A</i> and boar taint in pigs

2008· article· en· W2076527015 sur OpenAlexaff
J. Peacock, Yanping Lou, K. Lundström, E. James Squires

Notice bibliographique

RevueAnimal Genetics · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMolecular Biology Techniques and Applications
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAndrostenoneBiologyBOARGenotypeSkatoleBoar taintSNPGenotype frequencyAlleleAllele frequencyGeneticsAnimal scienceGeneSingle-nucleotide polymorphismSemenBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The level of cytochrome b5A (CYB5A) in pig testis is correlated with boar taint from androstenone and an AF016388:c.-8G>T polymorphism in CYB5A has been linked with low androstenone levels in the fat of pigs. In this study, we developed a polymerase chain reaction-based assay to genotype 1242 boars from eight lines for the c.-8G>T SNP. The c.-8T allele was found in all eight lines at a frequency ranging from 1.8% to 20.3% with an overall frequency of 8.6%. Significant deviations from Hardy-Weinberg equilibrium were found in the Hampshire, Landrace and Yorkshire breeds. The homozygous mutant c.-8TT occurred infrequently and was not found in some lines, but was consistently associated with low androstenone levels in fat. Both CYB5A mRNA and CYB5A protein levels were decreased in the c.-8TT genotype in a subset of Yorkshire boars, suggesting that low levels of CYB5A protein in the c.-8TT mutant were not due to inefficient translation of CYB5A mRNA. There were significant but modest marker effects on fat androstenone levels in Landrace, Yorkshire and a Large White/Duroc cross and fat skatole in Duroc and Sire Line breeds. There was no effect of CYB5A genotype on bulbourethral gland length, suggesting that this SNP will not affect reproductive traits. We conclude that the c.-8G>T SNP in the CYB5A gene has a significant but modest effect on boar taint in male pigs and could be useful in some breeds as part of a panel of SNP markers in a marker-assisted selection programme to produce low boar taint pigs.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,021
Score d'incertitude au seuil0,255

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,235
Écart entre enseignants0,228 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations18
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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