MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2076546617 · doi:10.1021/ja207172s

Roseobacticides: Small Molecule Modulators of an Algal-Bacterial Symbiosis

2011· article· en· W2076546617 sur OpenAlexfundno aff
Mohammad R. Seyedsayamdost, Gavin Carr, Roberto Kolter, Jon Clardy

Notice bibliographique

RevueJournal of the American Chemical Society · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueMicrobial Community Ecology and Physiology
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesNational Institute of General Medical SciencesLife Sciences Research FoundationNational Institutes of HealthUniversity of AlbertaNovartisFoundation for the National Institutes of Health
Mots-clésRoseobacterEmiliania huxleyiSymbiosisChemistryBacteriaMarine bacteriophageEukaryoteBiologyBiochemistryPhytoplanktonCladeGeneGeneticsPhylogenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Marine bacteria and microalgae engage in dynamic symbioses mediated by small molecules. A recent study of Phaeobacter gallaeciensis, a member of the large roseobacter clade of α-proteobacteria, and Emiliania huxleyi, a prominent member of the microphytoplankton found in large algal blooms, revealed that an algal senescence signal produced by E. huxleyi elicits the production of novel algaecides, the roseobacticides, from the bacterial symbiont. In this report, the generality of these findings are examined by expanding the number of potential elicitors. This expansion led to the identification of nine new members of the roseobacticide family, rare bacterial troponoids, which provide insights into both their biological roles and their biosynthesis. The qualitative and quantitative changes in the levels of roseobacticides induced by the additional elicitors and the elicitors' varied efficiencies support the concept of host-targeted roseobacticide production. Structures of the new family members arise from variable substituents at the C3 and C7 positions of the roseobacticide core as the diversifying elements and suggest that the roseobacticides result from modifications and combinations of aromatic amino acids. Together these studies support a model in which algal senescence converts a mutualistic bacterial symbiont into an opportunistic parasite of its hosts.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,071
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,222
Écart entre enseignants0,207 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations149
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of the American Chemical SocietyMême sujetMicrobial Community Ecology and PhysiologyTravaux en français237 207