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Enregistrement W2076583650 · doi:10.1371/journal.pone.0043956

A Novel Role for the Transcription Factor Cwt1p as a Negative Regulator of Nitrosative Stress in Candida albicans

2012· article· en· W2076583650 sur OpenAlexafffund
Adnane Sellam, Faïza Tebbji, Malcolm Whiteway, André Nantel

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAntifungal resistance and susceptibility
Établissements canadiensBiotechnology Research InstituteUniversité de MontréalMcGill UniversityInstitute for Research in Immunology and Cancer
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchFonds Québécois de la Recherche sur la Nature et les Technologies
Mots-clésRegulonCandida albicansRegulatorBiologyTranscriptional regulationTranscriptomeTranscription factorCorpus albicansRegulation of gene expressionPsychological repressionGeneCell biologyGene expressionGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The ability of Candida albicans to survive in the presence of nitrosative stress during the initial contact with the host immune system is crucial for its ability to colonize mammalian hosts. Thus, this fungus must activate robust mechanisms to neutralize and repair nitrosative-induced damage. Until now, very little was known regarding the regulatory circuits associated with reactive nitrogen species detoxification in fungi. To gain insight into the transcriptional regulatory networks controlling nitrosative stress response (NRS) in C. albicans a compilation of transcriptional regulator-defective mutants were screened. This led to the identification of Cwt1p as a negative regulator of NSR. By combining genome-wide location and expression analyses, we have characterized the Cwt1p regulon and demonstrated that Cwt1p is directly required for proper repression of the flavohemoglobin Yhb1p, a key NO-detoxification enzyme. Furthermore, Cwt1p operates both by activating and repressing genes of specific functions solicited upon NSR. Additionally, we used Gene Set Enrichment Analysis to reinvestigate the C. albicans NSR-transcriptome and demonstrate a significant similarity with the transcriptional profiles of C. albicans interacting with phagocytic host-cells. In summary, we have characterized a novel negative regulator of NSR and bring new insights into the transcriptional regulatory network governing fungal NSR.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,058
Tête enseignante GPT0,279
Écart entre enseignants0,221 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations34
Publié2012
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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