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Enregistrement W2076613042 · doi:10.1021/pr800979e

Serum Proteomic Approach for the Identification of Serum Biomarkers Contributed by Oral Squamous Cell Carcinoma and Host Tissue Microenvironment

2009· article· en· W2076613042 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueJournal of Proteome Research · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueClusterin in disease pathology
Établissements canadiensMcGill UniversityJewish General Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésClusterinProteomicsBiologyCancerCancer researchEpidermal growth factor receptorQuantitative proteomicsProteomePathologyMedicineBioinformaticsApoptosisGeneBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The lack of serum biomarkers for head and neck carcinoma limits early diagnosis, monitoring of advanced disease, and prediction of relapses in patients. We conducted a comprehensive proteomics study on serum from mice bearing orthotopic human oral squamous cell carcinomas (OSCC) with distinct invasive phenotypes. Matched established cell lines were transplanted orthotopically into tongues of RAG-2/gamma(c) mice and mouse serum was analyzed by 2-dimensional-differential gel electrophoresis(2D-DIGE)/liquid chromatography (LC)-MS/MS and by online 2D-LC-MS/MS of iTRAQ labeled samples. We identified several serum proteins as being differentially expressed between control and cancer-bearing mice and between noninvasive and invasive cancer (p<0.05). Differentially expressed proteins of human origin included the epidermal growth factor receptor (EGFR), cytokeratins, G-protein coupled receptor 87, Rab11 GTPase, PDZ-domain containing proteins, and PEST-containing nuclear proteins. Identified proteins of mouse origin included clusterin, titin, vitronectin, vitamin D-binding protein, hemopexin, and kininogen I. The levels of serum and cell secreted EGFR were further validated to match proteomic data regarding the inverse correlation with the invasive phenotype. In summary, we report a comprehensive patient-based proteomics approach for the identification of potential serum biomarkers for OSCC using an orthotopic xenograft mouse model.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,004
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,326
Score d'incertitude au seuil0,409

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0040,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,035
Tête enseignante GPT0,343
Écart entre enseignants0,308 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle