Backbone Dynamics of Receptor Binding and Antigenic Regions of a<i> Pseudomonas</i> <i>aeruginosa</i> Pilin Monomer
Notice bibliographique
Résumé
Pilin is the major structural protein that forms type IV pili of various pathogenic bacteria, including Pseudomonas aeruginosa. Pilin is involved in attachment of the bacterium to host cells during infection, in the initiation of immune response, and serves as a receptor for a variety of bacteriophage. We have used (15)N nuclear magnetic resonance relaxation measurements to probe the backbone dynamics of an N-terminally truncated monomeric pilin from P. aeruginosa strain K122-4. (15)N-T(1), -T(2), and [(1)H]-(15)N nuclear Overhauser enhancement measurements were carried out at three magnetic field strengths. The measurements were interpreted using the Lipari-Szabo model-free analysis, which reveals the amplitude of spatial restriction for backbone N-NH bond vectors with respect to nano- to picosecond time-scale motions. Regions of well-defined secondary structure exhibited consistently low-amplitude spatial fluctuations, while the terminal and loop regions showed larger amplitude motions in the subnano- to picosecond time-scale. Interestingly, the C-terminal disulfide loop region that contains the receptor binding domain was found to be relatively rigid on the pico- to nanosecond time-scale but exhibited motion in the micro- to millisecond time-scale. It is notable that this disulfide loop displays a conserved antigenic epitope and mediates binding to the asialo-GM(1) cell surface receptor. The present study suggests that a rigid backbone scaffold mediates attachment to the host cell receptor, and also maintains the conformation of the conserved antigenic epitope for antibody recognition. In addition, slower millisecond time-scale motions are likely to be crucial for conferring a range of specificity for these interactions. Characterization of pilin dynamics will aid in developing a detailed understanding of infection, and will facilitate the design of more efficient anti-adhesin synthetic vaccines and therapeutics against pathogenic bacteria containing type IV pili.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».