MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2076758417 · doi:10.1016/j.jalz.2010.08.194

P4‐135: Automatic Anatomical Structure Segmentation Predicts Conversion from MCI to AD

2010· article· en· W2076758417 sur OpenAlexaff
D. Louis Collins, Vladimir Fonov, Simon Duchesne

Notice bibliographique

RevueAlzheimer s & Dementia · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueBrain Tumor Detection and Classification
Établissements canadiensMcGill UniversityMontreal Neurological Institute and Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSegmentationLateral ventriclesNeuroimagingDiscriminative modelLinear discriminant analysisMagnetic resonance imagingMedicineNuclear medicineVentricleHippocampusArtificial intelligencePattern recognition (psychology)PsychologyComputer scienceNeuroscienceRadiologyPathologyCardiologyInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Volumetry of certain structures has demonstrated discriminative power to predict conversion from MCI to AD. We have previously developed tools to automatically segment hippocampus (HC) [Collins, ICAD09], lateral ventricles [Fonov, ISMRM2010] and other anatomical structures from MRI data [Collins, Human Brain Mapping 1995;3:190-208]. We applied these tools to a subset of baseline MCI data from the Alzheimer's Disease Neuroimaging Initiative (ADNI). T1w 3D MPRAGE MRI data for 200 MCI subjects were randomly selected from the baseline scans of the ADNI database. By 12 months, follow-up data was available for 163 of the 200 subjects, where 36 of these (22% of followup) converted to AD (the remained stable or reverted to normal). By 24 months, follow-up data was available for 136 subjects of the 200 original MCI subjects, where 58 subjects (42.3% of followup) had converted to AD and 69 remained stable or reverted to normal. Our goal was to predict which MCI subjects would convert to AD using only the baseline MRI data. MRI data were corrected for image intensity non-uniformity [Sled, Trans Med Imag 1998;17:87-97], stereotaxically transformed [Collins, J Comput Assist Tomog 1994;18:192-205] and resampled onto a 1mm3 grid. ANIMAL+fusion was used to segment HC on the left and right sides and to segment lateral ventricle. Our ANIMAL model-based, automatic structure segmentation procedure was used to segment 36 other anatomical structures. All volumes were entered as features into a linear discriminant analysis (LDA). Using 10 optimally selected variables yields 73.9% accuracy, 69% sensitivity and 74% specificity for prediction of conversion at 12m. Important discriminatory variables included hippocampus, lateral ventricle, caudate, frontal white matter (WM) and parietal WM. (Noise in brain masking reduced discriminatory power of cortical structures). Prediction accuracy at 24m dropped to 65%. Automatic structure segmentation is robust and accurate and does not suffer from inter-rater variability. The structure volumes can be combine to create a linear discriminant function that predicts progression with high accuracy. Such a tool will enable enrichment of clinical trials and could be used for patient selection for early treatment.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,032
Score d'incertitude au seuil0,998

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,266
Écart entre enseignants0,244 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2010
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueAlzheimer s & DementiaMême sujetBrain Tumor Detection and ClassificationTravaux en français237 207