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Enregistrement W2076828114 · doi:10.1165/rcmb.2008-0219oc

Human Alveolar Macrophage Gene Responses to <i>Mycobacterium tuberculosis</i> Strains H37Ra and H37Rv

2008· article· en· W2076828114 sur OpenAlexaff
Richard F. Silver, Jessica Walrath, Hung Lee, Bruce A. Jacobson, Heidi F. Horton, Michael Bowman, Karl Nocka, Joseph P. Sypek

Notice bibliographique

RevueAmerican Journal of Respiratory Cell and Molecular Biology · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueTuberculosis Research and Epidemiology
Établissements canadiensWomen's Health Research Institute
Organismes subventionnairesCase Western Reserve UniversityNational Institutes of HealthNational Heart, Lung, and Blood InstituteSchool of Medicine, Case Western Reserve UniversityNational Center for Research ResourcesOffice of Research and DevelopmentU.S. Department of Veterans Affairs
Mots-clésBiologyMycobacterium tuberculosisVirulenceGeneDNA microarrayTuberculosisGene expressionMicroarrayImmunityMicrobiologyMicroarray analysis techniquesGene chip analysisImmune systemImmunologyGeneticsMedicinePathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

H37Rv and H37Ra have been widely used as models of virulent and avirulent strains, respectively, of Mycobacterium tuberculosis. Since the sequencing of H37Rv, microarrays have been used to investigate gene expression of M. tuberculosis strains under various conditions, and to compare gene expression of specific isolates of the organism. Because differences in the virulence of these organisms could also be manifest via their differential induction of host genes, we used Affymetrix Human Genome Arrays U133A and U133B to evaluate human alveolar macrophage (AM) responses to infection with H37Rv and H37Ra. H37Rv altered expression of far more genes than did H37Ra. Moreover, the genes induced by H37Rv to a greater extent than by H37Ra were predominantly associated with the development of effective immunity. H37Rv markedly increased expression of IL-23 p19, whereas neither organism significantly induced IL-12 p35 expression. Quantitative PCR confirmed that H37Rv induced significantly more AM p19 expression than did H37Ra. After low-level infection of both AM and peripheral blood monocytes (MN) with H37Rv, neither cell type produced IL-12 (by ELISA). In contrast, AM displayed significant IL-23 production in response to H37Rv, whereas MN did not. Our findings thus suggest an important role for IL-23 in human host responses to pulmonary infection with M. tuberculosis, and are consistent with epidemiologic and genetic studies that imply that H37Rv may not have unusual capacity to cause human disease.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,598
Score d'incertitude au seuil0,808

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,316
Écart entre enseignants0,297 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations64
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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