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Enregistrement W2076944129 · doi:10.1161/circulationaha.110.987248

Striking In Vivo Phenotype of a Disease-Associated Human <i>SCN5A</i> Mutation Producing Minimal Changes in Vitro

2011· article· en· W2076944129 sur OpenAlexaff
Hiroshi Watanabe, Tao Yang, Dina Myers Stroud, J. S. Lowe, Louise Harris, Thomas C. Atack, Dao Wen Wang, Susan B. Hipkens, Brenda F. Leake, Lynn Hall, Sabina Kupershmidt, Nagesh Chopra, Mark A. Magnuson, Naohito Tanabe, Björn C. Knollmann, Alfred L. George, Dan M. Roden

Notice bibliographique

RevueCirculation · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCardiac electrophysiology and arrhythmias
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesEunice Kennedy Shriver National Institute of Child Health and Human DevelopmentNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesNational Heart, Lung, and Blood InstituteVanderbilt University Medical CenterFondation LeducqNational Cancer InstituteNational Institutes of HealthNational Eye InstituteVanderbilt University
Mots-clésMedicinePhenotypeMutationIn vivoIn vitroClinical phenotypeGeneticsGeneBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: The D1275N SCN5A mutation has been associated with a range of unusual phenotypes, including conduction disease and dilated cardiomyopathy, as well as atrial and ventricular tachyarrhythmias. However, when D1275N is studied in heterologous expression systems, most studies show near-normal sodium channel function. Thus, the relationship of the variant to the clinical phenotypes remains uncertain. METHODS AND RESULTS: We identified D1275N in a patient with atrial flutter, atrial standstill, conduction disease, and sinus node dysfunction. There was no major difference in biophysical properties between wild-type and D1275N channels expressed in Chinese hamster ovary cells or tsA201 cells in the absence or presence of β1 subunits. To determine D1275N function in vivo, the Scn5a locus was modified to knock out the mouse gene, and the full-length wild-type (H) or D1275N (DN) human SCN5A cDNAs were then inserted at the modified locus by recombinase mediated cassette exchange. Mice carrying the DN allele displayed slow conduction, heart block, atrial fibrillation, ventricular tachycardia, and a dilated cardiomyopathy phenotype, with no significant fibrosis or myocyte disarray on histological examination. The DN allele conferred gene-dose-dependent increases in SCN5A mRNA abundance but reduced sodium channel protein abundance and peak sodium current amplitudes (H/H, 41.0±2.9 pA/pF at -30 mV; DN/H, 19.2±3.1 pA/pF, P<0.001 vs. H/H; DN/DN, 9.3±1.1 pA/pF, P<0.001 versus H/H). CONCLUSIONS: Although D1275N produces near-normal currents in multiple heterologous expression experiments, our data establish this variant as a pathological mutation that generates conduction slowing, arrhythmias, and a dilated cardiomyopathy phenotype by reducing cardiac sodium current.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,747
Score d'incertitude au seuil0,323

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,255
Écart entre enseignants0,231 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations139
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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