Maternal housekeeping proteins translated during bovine oocyte maturation and early embryo development
Notice bibliographique
Résumé
Protein synthesis from maternal mRNA is needed to sustain oocyte maturation and embryo development prior to the maternal-embryonic transition (MET). Therefore, proteins that are expressed throughout this time are important and may be considered as maternal housekeeping proteins (MHKP). Our objectives were first, identify the translated protein patterns of bovine embryo development and secondly, determine the MHKP. Proteins synthesized during oocyte maturation and embryo development (2, 4 and 8-cell stages) were labeled using [S(35)]-Met and [S(35)]-Cys, and visualized by 2-DE. Embryos were cultured with alpha-amanitine to inhibit new transcription. Only 46 proteins were present throughout all stages. Ten spots were identified by MALDI-TOF and MS/MS: HSC71; HSP70; CypA; UCH-L1; GSTM5; Cct5; E-FABP; 2,3-BPGM, ubiquitin-conjugating enzyme E2D3; and beta-actin/gamma-actin. A new method called in silico protein identification confirmation was developed using EST databases. This method is a promising approach for use in rare tissue or from species with an incomplete protein database. This study has revealed that the translated protein patterns show a transition that brings the embryo to the MET. The needs in translated proteins between oocyte maturation and embryo development are different. In summary, this study represents the bases for future proteomics studies on bovine oocytes and embryos.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».