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Enregistrement W2077199974 · doi:10.1016/j.femsec.2004.02.001

Diversity of methanotroph communities in a basalt aquifer

2004· article· en· W2077199974 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueFEMS Microbiology Ecology · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMicrobial metabolism and enzyme function
Établissements canadiensUniversity of Victoria
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMethanotrophBiologyMethane monooxygenaseLibrary16S ribosomal RNAArchaeaEcologyAnaerobic oxidation of methaneBacteriaMethaneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Methanotrophic bacteria play an important role in global cycling of carbon and co-metabolism of contaminants. Methanotrophs from pristine regions of the Snake River Plain Aquifer (SRPA; Idaho, USA) were studied in order to gain insight into the native groundwater communities' genetic potential to carry out TCE co-metabolism. Wells were selected that were proximal to a TCE plume believed to be undergoing natural attenuation. Methane concentrations ranged from 1 to >1000 nM. Carbon isotope ratios and diversity data together suggest that the SRPA contains active communities of methanotrophs that oxidize microbially produced methane. Microorganisms removed from groundwater by filtration were used as inocula for enrichments or frozen immediately and DNA was subsequently extracted for molecular characterization. Primers that specifically target methanotroph 16S rRNA genes or genes that code for subunits of soluble or particulate methane monooxygenase, mmoX and pmoA, respectively, were used to characterize the indigenous methanotrophs via PCR, cloning, RFLP analysis, and sequencing. Type I methanotroph clones aligned with Methylomonas, Methylocaldum, and Methylobacter sequences and a distinct 16S rRNA phylogenetic lineage grouped near Methylobacter. The majority of clone sequences in type II methanotroph 16S rRNA, pmoA, and mmoX gene libraries grouped closely with sequences in the Methylocystis genus. A subset of the type II methanotroph clones from the aquifer had sequences that aligned most closely to Methylosinus trichosporium OB3b and Methylocystis spp., known TCE-co-metabolizing methanotrophs.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,128
Score d'incertitude au seuil0,612

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,213
Écart entre enseignants0,202 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle