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Enregistrement W2077291451 · doi:10.1002/gcc.20892

Knockdown of <i>RARB2</i> identifies a dual role in cancer

2011· article· en· W2077291451 sur OpenAlexaff
Jane J. Pappas, André Toulouse, Mark Basik, Luc Lévesque, W. E. C. Bradley

Notice bibliographique

RevueGenes Chromosomes and Cancer · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRetinoids in leukemia and cellular processes
Établissements canadiensJewish General HospitalUniversité de MontréalMcGill University
Organismes subventionnairesNational Human Genome Research Institute
Mots-clésLung cancerGene knockdownCarcinogenesisCancer researchCancerTreatment of lung cancerMedicineCell cultureCell growthBiologyApoptosisOncologyInternal medicineGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Two chemoprevention trials have shown that retinoic acid (RA) may be harmful in patients at risk for lung cancer, and RA administration to this high-risk group results in RARB2 reactivation. Although RARB2 is thought to possess tumor suppressive activity, its expression has recently been correlated with poorer prognosis in patients with nonsmall cell lung cancer. We hypothesized that RARB2 expression is necessary for the growth and maintenance of the oncogenic phenotype in lung cancer cells in which RARB2 has not been inactivated. We tested various antisense oligodeoxynucleotides (ASO) against RARB2 in multiple lung cancer cell lines and used microarray technology to compare the patterns of gene expression following ASO treatment versus RA treatment in the A-549 lung cancer cell line. We show that ASO treatment reduces proliferation and causes apoptosis in 3 RARB2-expressing lung cancer cell lines but has no apparent effect in at least two other lung cancer cells lines having lost RARB2 expression or one normal lung RARB2-expressing cell line; we demonstrate a correlation between resulting RARB2 expression levels and cell growth; and identify transcriptional effects related to both RA and RARB2 signaling. In particular, five genes known to contribute to carcinogenesis or chemotherapeutic resistance are down-regulated following ASO treatment: three of these are up-regulated following RA treatment. This work demonstrates a dual role for RARB2 (tumor suppression and tumor promotion) and identifies a challenge with respect to using RARB2 as a target for treatment or prevention strategies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,061
Score d'incertitude au seuil0,475

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,249
Écart entre enseignants0,235 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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