Avian Reovirus Temperature-Sensitive Mutant <i>tsA12</i> Has a Lesion in Major Core Protein σA and Is Defective in Assembly
Notice bibliographique
Résumé
Members of our laboratory previously generated and described a set of avian reovirus (ARV) temperature-sensitive (ts) mutants and assigned 11 of them to 7 of the 10 expected recombination groups, named A through G (M. Patrick, R. Duncan, and K. M. Coombs, Virology 284:113-122, 2001). This report presents a more detailed analysis of two of these mutants (tsA12 and tsA146), which were previously assigned to recombination group A. The capacities of tsA12 and tsA146 to replicate at a variety of temperatures were determined. Morphological analyses indicated that cells infected with tsA12 at a nonpermissive temperature produced approximately 100-fold fewer particles than cells infected at a permissive temperature and accumulated core particles. Cells infected with tsA146 at a nonpermissive temperature also produced approximately 100-fold fewer particles, a larger proportion of which were intact virions. We crossed tsA12 with ARV strain 176 to generate reassortant clones and used them to map the temperature-sensitive lesion in tsA12 to the S2 gene. S2 encodes the major core protein sigmaA. Sequence analysis of the tsA12 S2 gene showed a single alteration, a cytosine-to-uracil transition, at nucleotide position 488. This alteration leads to a predicted amino acid change from proline to leucine at amino acid position 158 in the sigmaA protein. An analysis of the core crystal structure of the closely related mammalian reovirus suggested that the Leu(158) substitution in ARV sigmaA lies directly under the outer face of the sigmaA protein. This may cause a perturbation in sigmaA such that outer capsid proteins are incapable of condensing onto nascent cores. Thus, the ARV tsA12 mutant represents a novel assembly-defective orthoreovirus clone that may prove useful for delineating virus assembly.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».