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Enregistrement W2077449411 · doi:10.1007/s10545-006-0247-6

Expression profiling reveals multiple myelin alterations in murine succinate semialdehyde dehydrogenase deficiency

2006· article· en· W2077449411 sur OpenAlexaff
Elizabeth A. Donarum, Dietrich Stephan, Kay Larkin, Eric J. Murphy, Maneesh Gupta, Henry Senephansiri, Robert C. Switzer, Phillip L. Pearl, O. Carter Snead, C. Jakobs, K. Michael Gibson

Notice bibliographique

RevueJournal of Inherited Metabolic Disease · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMetabolomics and Mass Spectrometry Studies
Établissements canadiensHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesNational Institute of Neurological Disorders and Stroke
Mots-clésMyelinProteolipid protein 1BiologyMyelin basic proteinNeuroactive steroidEndocrinologyGABAergicInternal medicineMolecular biologyBiochemistryGABAA receptorCentral nervous systemReceptorMedicineInhibitory postsynaptic potential

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Succinic semialdehyde dehydrogenase (SSADH) deficiency, a rare genetic defect of GABA degradation recently modelled in mice (SSADH(-/-) mice), manifests early absence seizures that evolve into generalized convulsive seizures and lethal status epilepticus in gene-ablated mice. Disrupted GABA homeostasis, in conjunction with the epileptic phenotype and increased gamma-hydroxybutyric acid (GHB), suggested that expression profiling with the U74Av2 Affymetrix system would reveal dysregulation of receptor genes associated with GABAergic and glutamatergic neurotransmission. Unexpectedly, we found significant downregulation for genes associated with myelin biogenesis and compaction, predominantly in hippocampus and cortex. These results were confirmed by: (1) myelin basic protein (MBP) immunohistochemistry; (2) western blotting of myelin-associated glycoprotein (MAG) and MBP; (3) qRT-PCR analyses of myelin-associated oligodendrocytic basic protein (MOBP), MAG, MBP and proteolipid protein (PLP) in hippocampus, cortex and spinal cord; (4) quantitation of ethanolamine and choline plasmalogens, all core myelin components; (5) evaluation of myelin content in brain sections employing toluidine blue staining; and (6) ultrastructural evaluation of myelin sheath thickness via electron microscopy. We speculate that increased GABA/GHB, acting through GABAergic systems, results in decreased levels of the neurosteroids progesterone and allopregnanolone [Gupta et al (2003) Ann Neurol 54(Supplement 6): S81-S90] and phosphorylation of mitogen-activated protein (MAP) kinase, with resulting myelin protein abnormalities primarily in the cortex of SSADH(-/-) mice.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,162
Score d'incertitude au seuil0,745

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,245
Écart entre enseignants0,237 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations27
Publié2006
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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