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Enregistrement W2077541544 · doi:10.1097/tp.0b013e3182708e7c

Multiple Single-Nucleotide Polymorphism–Based Risk Model for Clinical Outcomes After Allogeneic Stem-Cell Transplantation, Especially for Acute Graft-Versus-Host Disease

2012· article· en· W2077541544 sur OpenAlexaff
Dennis Kim, Jina Yun, Hong‐Hee Won, Lu Cheng, Jie Su, Wei Xu, Jieun Uhm, Vikas Gupta, John Kuruvilla, Hans A. Messner, Jeffrey H. Lipton

Notice bibliographique

RevueTransplantation · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHematopoietic Stem Cell Transplantation
Établissements canadiensPrincess Margaret Cancer Centre
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSingle-nucleotide polymorphismMedicineTransplantationSNPInternal medicineGraft-versus-host diseaseOncologyHematologyUnivariate analysisDiseaseImmunologyMultivariate analysisGastroenterologyGenotypeGeneBiologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: We aimed to develop multiple single-nucleotide polymorphism (SNP)-based risk models associated with the risk of transplant outcomes including graft-versus-host disease (GVHD). METHODS: The study evaluated 259 SNPs in 53 genes in 394 pairs of donors and recipients. In a discovery set (n=307 receiving related donor transplantation), overall survival, relapse-free survival (RFS), nonrelapse mortality, and acute or chronic GVHD were evaluated. RESULTS: Eight recipients' SNPs of IL2, IL6R, FAS, EDN1, TGFB1, and NFKBIA genes and 12 donors' SNPs of NOS1, IL1B, TGFB2, NOD2/CARD15, TNFRII, IL1R1, and FCGR2A genes were identified in univariate analyses. Risk models were generated using significant clinical variables and genetic SNP markers after filtering out through multivariate analyses. Then, we divided patients into four quartiles (25%, Q) according to their risks. The final models stratified patients into low-risk (Q1), moderate-risk (Q2, Q3), and high-risk (Q4) groups in terms of overall survival (P<0.0001), RFS (P<0.0001), nonrelapse mortality (P=0.0043), and acute GVHD (P<0.0001), but not for chronic GVHD (P=0.763). External validation was performed in 87 transplant pairs that received matched unrelated donor transplantation, especially for RFS (P=0.016) and acute GVHD (P=0.027). CONCLUSION: Risk models can improve prognostic stratification of patients according to their risk for transplant outcome.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,392
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,061
Tête enseignante GPT0,334
Écart entre enseignants0,273 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations23
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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