Characterization of Ciprofloxacin Resistance in Neisseria gonorrhoeae Isolates in Canada
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Ciprofloxacin (500 mg orally, single dose) is one of the recommended therapies for gonorrhea in Canada. In Canada, the first ciprofloxacin-resistant (CipR) Neisseria gonorrhoeae strain was isolated in 1993. Antimicrobial susceptibilities of N gonorrhoeae isolates were monitored as part of a national surveillance program to ensure efficacy of antimicrobial therapies. GOAL: The goal was to determine the characteristics of ciprofloxacin resistance in Canadian gonococcal isolates. STUDY DESIGN: Susceptibility testing was performed on gonococcal strains from different provinces in Canada to determine the prevalence of CipR strains and their distribution. The CipR strains were further differentiated according to auxotype (A), serotype (S), plasmid profile (P), and pulsed-field gel electrophoresis (PFGE) profile. DNA sequencing and DNA microarray technology were used to determine mutations in gyrA and parC. RESULTS: In Canada, between 1997 and 1999, 4.8% of resistant strains (130 of 2687 antibiotic-resistant N gonorrhoeae isolates) were CipR (MICs of 1-32 microg/l) and belonged to 48 A/S/P classes. Sixty-eight of the strains that were not differentiated by A/S/P were subtyped into 47 classes with PFGE. DNA sequencing and DNA microarray showed that the most common mutations had amino acid substitutions of Ser-->Phe at codon 91 and Asp-->Gly at codon 95 of the gyrA and Ser-->Arg at codon 87 of parC. CONCLUSION: The CipR strains isolated in Canada are phenotypically and genotypically diverse, indicating that they were imported from overseas and not endemic in Canada. Mutations in gyrA and parC previously only identified by DNA sequencing were successfully identified with DNA microarray technology. DNA microarray technology could be an alternative tool for identifying point mutations in resistance genes or other epidemiologic markers when clinical laboratories replace culture methods with rapid and automated molecular methods for diagnosis.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».