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Enregistrement W2077700239 · doi:10.3892/or.2014.3534

Reduced expression of SRY-box containing gene 17 correlates with an unfavorable melanoma patient survival

2014· article· en· W2077700239 sur OpenAlexafffund
Jing Lü, Guohong Zhang, Yabin Cheng, Yun Tang, Ziming Dong, Kevin J. McElwee, Gang Li

Notice bibliographique

RevueOncology Reports · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenomics and Chromatin Dynamics
Établissements canadiensVancouver Coastal Health Research InstituteUniversity of British ColumbiaVancouver Coastal Health
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchCancer Research SocietyNational Natural Science Foundation of ChinaCanadian Dermatology Foundation
Mots-clésMelanomaMedicineCancerOncologyInternal medicineTissue microarrayStage (stratigraphy)OncogeneCancer researchCell cyclePathologyBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

SRY-box containing gene 17 (Sox17), a transcription factor, is considered as an antagonist to canonical Wnt/β‑catenin signaling in several types of malignant tumors. As the influence of Sox17 in the pathogenesis of human melanoma is still unknown, the investigation of Sox17 expression in melanoma is warranted and its prognostic value is of great interest. In the present study, Sox17 expression was examined in 525 cases of melanocytic lesions (33 common acquired nevi, 59 dysplastic nevi, 291 primary melanomas and 142 metastatic melanomas) at different stages by tissue microarray. The correlation of Sox17 expression with melanoma progression and its prognostic value in melanoma patients were examined. We also analyzed the correlation between Sox17 and cyclin-dependent kinase inhibitor p27 expression in 374 melanoma samples. The results showed that Sox17 expression was significantly decreased in primary and metastatic melanoma compared to common acquired nevi and dysplastic nevi (P=2.4x10-17). Furthermore, Sox17 expression was inversely correlated with American Joint Committee on Cancer stage (P=4.6x10-15), thickness (P=0.00004) and ulceration (P=0.03). Notably, reduced Sox17 expression was correlated with a poorer overall and disease-specific 5- and 10-year survival of the patients. Multivariate Cox regression analyses indicated that Sox17 is an independent prognostic marker for melanoma patients. Moreover, we found a significant positive correlation between Sox17 and p27 expression in melanoma biopsies; their concomitant expression was closely correlated with the survival of melanoma patients. Taken together, decreased Sox17 expression is correlated with melanoma progression, an unfavorable survival of melanoma patients and is an independent molecular prognostic factor for melanoma.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,232
Écart entre enseignants0,226 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2014
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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