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Enregistrement W2077722338 · doi:10.1107/s1744309111026273

Crystallization and preliminary X-ray diffraction analysis of prion protein bound to the Fab fragment of the POM1 antibody

2011· article· en· W2077722338 sur OpenAlexaff
Pravas Kumar Baral, Barbara Wieland, Mridula Swayampakula, Magdalini Polymenidou, Adriano Aguzzi, Nat N. V. Kav, Michael N.G. James

Notice bibliographique

RevueActa Crystallographica Section F Structural Biology and Crystallization Communications · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePrion Diseases and Protein Misfolding
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGene isoformPrion proteinAntibodyChemistryMolecular biologyBiochemistryBiologyGeneImmunology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Prion diseases are neurodegenerative diseases that are characterized by the conversion of the cellular prion protein PrP(c) to the pathogenic isoform PrP(sc). Several antibodies are known to interact with the cellular prion protein and to inhibit this transition. An antibody Fab fragment, Fab POM1, was produced that recognizes a structural motif of the C-terminal domain of mouse prion protein. To study the mechanism by which Fab POM1 recognizes and binds the prion molecule, the complex between Fab POM1 and the C-terminal domain of mouse prion (residues 120-232) was prepared and crystallized. Crystals of this binary complex belonged to the monoclinic space group C2, with unit-cell parameters a = 83.68, b = 106.9, c = 76.25 Å, β = 95.6°.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,959
Score d'incertitude au seuil0,477

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,272
Écart entre enseignants0,258 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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