Dependence of the Bi-functional Nature of a Sialyltransferase from Neisseria meningitidis on a Single Amino Acid Substitution
Notice bibliographique
Résumé
The L1 immunotype strain 126E of Neisseria meningitidis has been shown to have an N-acetyl-neuraminic acid-containing lipooligosaccharide in which an alpha-linked galactose from a P(k) epitope is substituted at the O6 position (Wakarchuk, W. W., Gilbert, M., Martin, A., Wu, Y., Brisson, J. R., Thibault, P., and Richards, J. C. (1998) Eur. J. Biochem. 254, 626-633). Using a synthetic P(k)-epitope containing acceptor in glycosyltransferase reactions, we were able to show by NMR analysis of the reaction product that the 126E(L1)-derived sialyltransferase can make both alpha-2,3 and alpha-2,6 linkages to the terminal galactose. Gene disruption experiments showed that the lst gene in 126E(L1) was responsible for the in vivo addition of the alpha-2,6-linked N-acetyl-neuraminic acid residue. By site-directed mutagenesis it was possible to change the MC58(L3)-derived enzyme into a bifunctional enzyme with a single amino acid change at position 168, where a glycine was changed to an isoleucine. We performed a gene replacement experiment where the 126E(L1) alpha-2,3/6-sialyltransferase was replaced by allelic exchange with the monofunctional MC58(L3) alpha-2,3-sialyltransferase and with the mutant MC58(L3) allele G168I. We observed that the level of LOS sialylation with the G168I allele was very similar to that of the wild type 126E(L1), indicating that residue 168 is the critical residue for the alpha-2,6-sialyltransferase activity in vitro as well as in vivo.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».