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Enregistrement W2077810674 · doi:10.1021/jm000446q

Nonpeptidic, Monocharged, Cell Permeable Ligands for the p56lck SH2 Domain

2001· article· en· W2077810674 sur OpenAlexaff
John Proudfoot, Raj Betageri, Mario Cardozo, Thomas A. Gilmore, Susan L. Glynn, Eugene R. Hickey, Scott Jakes, Alisa K. Kabcenell, Thomas M. Kirrane, Annette K. Tibolla, Susan Lukas, Usha Patel, Rajiv P. Sharma, Mehran Yazdanian, Neil Moss, Pierre L. Beaulieu, Dale R. Cameron, Jean‐Marie Ferland, Jean Gauthier, James Gillard, Vida Gorys, Martin Poirier, Jean Rancourt, Dominik Wernic, Montse Llinàs‐Brunet

Notice bibliographique

RevueJournal of Medicinal Chemistry · 2001
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueMacrophage Migration Inhibitory Factor
Établissements canadiensBoehringer Ingelheim (Canada)
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésChemistrySH2 domainTetrapeptideProto-oncogene tyrosine-protein kinase SrcDipeptideSignal transductionTyrosine kinaseStereochemistryKinaseBiochemistryPeptide

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

p56lck is a member of the src family of tyrosine kinases and plays a critical role in the signal transduction events that lead to T cell activation. Ligands for the p56lck SH2 domain have the potential to disrupt the interaction of p56lck with its substrates and derail the signaling cascade that leads to the production of cytokines such as interleukin-2. Starting from the quintuply charged (at physiological pH) phosphorylated tetrapeptide, AcpYEEI, we recently disclosed (J. Med. Chem. 1999, 42, 722 and J. Med. Chem. 1999, 42, 1757) the design of the modified dipeptide 3, which carries just two charges at physiological pH. Here we present the elaboration of 3 to the nonpeptidic, monocharged compound, 9S. This molecule displays good binding affinity for the p56lck SH2 domain (K(d) 1 microM) and good cell permeation, and this combination of properties allowed us to demonstrate clear-cut inhibitory effects on a very early event in T cell activation, namely calcium mobilization.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,234
Écart entre enseignants0,223 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations13
Publié2001
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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