ATP Binding Residues of Sarcoplasmic Reticulum Ca<sup>2+</sup>‐ATPase
Notice bibliographique
Résumé
ATP-binding residues in the N and P domains of sarcoplasmic reticulum Ca-ATPase have been investigated using mutagenesis in combination with a binding assay based on the photolabeling of Lys(492) with [g-(32)P] 2',3'-O-(2,4,6 trinitrophenyl)-8-azido-ATP and competition with nucleotide. In the N domain, mutations to several residues in conserved motifs, (438)GEATE, (487)FSRDRK, (515)KGAPE, and (560)RCLALA produce nucleotide-binding defects. Key residues include Thr(441), Glu(442), Phe(487), Arg(489), Lys(492), Lys(515), Arg(560), and Leu(562). In the absence of Mg(2+), Arg(489), Lys(492), and Arg(560) are most important, whereas in its presence Thr(441) and Glu(442) also play a crucial role. In the P domain, Asp(351) is striking for its strong electrostatic repulsion of the gamma-phosphate, especially in the presence of Mg(2+). Lys(352) is a key residue, and Asp(627) and Lys(684) must come close to the nucleotide. Thr(353), Asn(359), Asp(601), and Asp(703) interact only in the presence of Mg(2+). Asn(706) and Asp(707) are unimportant for nucleotide binding. The results identify several ATP binding residues in the N and P domains and suggest that Mg(2+) changes the nucleotide/protein interaction in both. Models of bound ATP and MgATP are presented.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».