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Enregistrement W2077874393 · doi:10.1021/bi050338b

Phospholipid Regulates the Activation of Factor X by Tissue Factor/Factor VIIa (TF/VIIa) via Substrate and Product Interactions

2005· article· en· W2077874393 sur OpenAlexaff
James Hathcock, E. V. Rusinova, Rodney D. Gentry, Harry A.M. Andree, Yale Nemerson

Notice bibliographique

RevueBiochemistry · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueBlood Coagulation and Thrombosis Mechanisms
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPhospholipidChemistryTissue factorDimerVesicleFactor XBiophysicsEnzymeStereochemistryStokes radiusBiochemistryThrombinCoagulationSize-exclusion chromatographyMembraneBiologyOrganic chemistryPlatelet

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Although the phospholipid requirement for tissue factor (TF) activity has been well-established, the mechanism by which the surface regulates enzymatic activity remains unclear. We added phospholipid vesicles to already relipidated TF (30/70 PS/PC) and found that added lipid can both enhance and inhibit the rate of factor X (F.X) activation. Using active-site-inhibited F.Xa we demonstrate that F.Xa is a more potent inhibitor of TF/VIIa at lower lipid concentrations, and that this inhibition is attributable to high surface occupancy by F.Xa near the enzyme. We also find that exactly twice as many F.Xa molecules are bound to a lipid surface at saturation as F.X, and that a dimer model of F.Xa binding to the lipid can account for the experimentally observed, preferential binding of F.Xa (compared to F.X) to phospholipid surfaces. We manipulated the amount of phospholipid available to each TF molecule by controlling vesicle size and the number of TF molecules per vesicle and found that, as the 2D radius of phospholipid available to each TF molecule was increased, the observed k(cat) increased hyperbolically toward a maximum or "true k(cat)". At a 2D lipid radius of approximately 37 nm, the observed k(cat) was 50% of the "true k(cat)". Thus, phospholipid surface serves as a conduit for F.X presentation and F.Xa removal, and the rate at which F.Xa leaves the vicinity of the enzyme, either by lateral diffusion or desorption from the surface, regulates the rate of F.X activation. We argue that these findings require reevaluation of existing models of coagulation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,019
Score d'incertitude au seuil0,787

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,279
Écart entre enseignants0,259 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations31
Publié2005
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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