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Enregistrement W2077947709 · doi:10.1039/c2an35477b

Raman microspectroscopy of live cells under autophagy-inducing conditions

2012· article· en· W2077947709 sur OpenAlexafffund
S. O. Konorov, Mario A. Jardon, James M. Piret, Michael W. Blades, Robin F. B. Turner

Notice bibliographique

RevueThe Analyst · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueSpectroscopy Techniques in Biomedical and Chemical Research
Établissements canadiensUniversity of British ColumbiaCanada's Michael Smith Genome Sciences Centre
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésAutophagyRaman spectroscopyRaman microspectroscopyCell biologyGlutamineCell cultureCancer cellChemistryBiophysicsCellBiologyBiochemistryAmino acidCancerGeneticsApoptosis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The role of autophagy in numerous physiological responses triggered by a variety of mechanisms both in states of health and disease has raised considerable interest in this cellular process. However, the current analytical tools to study autophagy are either invasive or require genetic manipulation. Raman microspectroscopy is a potentially quantitative analytical method that has been shown to be useful for the label-free, non-destructive analysis of living biological cells and tissues. We present in this study initial efforts to study autophagy using Raman spectroscopy. The response of adherent mouse and human cancer cells to starvation conditions (glutamine deprivation and amino acid deprivation) was probed by Raman spectroscopy and compared to fluorescence microscopy results using autophagy-specific markers. We also demonstrate the capability of Raman spectroscopy to monitor the recovery dynamics of starved cells and to probe the heterogeneity in the response to starvation that can arise in cell populations. Finally, this work suggests that the 718 cm(-1) Raman line associated with phospholipids may be a useful spectral marker indicative of an autophagic response to starvation stimuli. Overall, this study establishes the utility of Raman spectroscopy to non-invasively detect biologically relevant changes in live cells exposed to conditions known to trigger autophagy.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,375

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,328
Écart entre enseignants0,316 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations24
Publié2012
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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