MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2078058967 · doi:10.1016/j.saa.2013.04.073

Detect changes in protein structure of carinata meal during rumen fermentation in relation to basic chemical profile and comparison with canola meal using ATR–FT/IR molecular spectroscopy with chemometrics

2013· article· en· W2078058967 sur OpenAlexafffund
Hangshu Xin, Peiqiang Yu

Notice bibliographique

RevueSpectrochimica Acta Part A Molecular and Biomolecular Spectroscopy · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueRuminant Nutrition and Digestive Physiology
Établissements canadiensUniversity of Saskatchewan
Organismes subventionnairesAgriculture and Agri-Food CanadaNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaBeef Cattle Research CouncilSaskatchewan Canola Development CommissionUniversity of Saskatchewan
Mots-clésCanolaRumenMealFermentationChemistryFood scienceFish mealIncubationBiologyBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

As far as we know, no study has been carried out on whether protein structure changes in the feed during rumen fermentation from other research team. This study was conducted to characterize protein structure spectral changes in carinata meal during ruminal fermentation using Fourier transform infrared spectroscopy (FT/IR) technique with ATR. The objectives were to find out whether (1) protein internal structure (in terms of protein amide profile and protein secondary structure profile) changed after in situ ruminal fermentation at 0, 12, 24 and 48 h in carinata meal and conventional canola meal was used as a reference; (2) there was any correlation between protein spectral parameters and basic chemical profile in in situ rumen residue samples; and (3) the protein structural chemical make-up of carinata meal differed from canola meal during 48 h rumen incubation. The results showed that protein structure features in both carinata meal and canola meal were altered as incubation time increased (P<0.0001) and linear and curvilinear relationships (P<0.05) on amide II height and area, height and area ratio of amide I and II as well as height ratio of α-helix and β-sheet were observed within 48 h ruminal fermentation. And the amide I height and area as well as α-helix height and β-sheet height were in the highest level of IR absorbance at 0 h and then gradually declined linearly (P<0.0001) by 30-38% after 48 h incubation. These results indicated that not only quantities decreased but also inherent structure changed in protein chemical make-up during ruminal fermentation. Meanwhile, strong correlations were found between protein spectral parameters and some basic nutrients profile such as CP (positively) and NDF (negatively). And both AHCA and PCA results showed that in situ rumen residues from carinata meal was not distinguished from those from canola meal, suggesting some relationship in structural make-up exhibited between them within protein region during 48 h rumen fermentation. Further studies are still needed to investigate detailed information on structural changes in protein of various feedstuffs in order to fully and deeply understand protein degradation during rumen fermentation on both metabolic basis and molecular biological basis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,106
Score d'incertitude au seuil0,946

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,231
Écart entre enseignants0,222 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations27
Publié2013
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueSpectrochimica Acta Part A Molecular and Biomolecular SpectroscopyMême sujetRuminant Nutrition and Digestive PhysiologyTravaux en français237 207