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Enregistrement W2078070626 · doi:10.1021/ja0446855

Off-Resonance R<sub>1ρ</sub> NMR Studies of Exchange Dynamics in Proteins with Low Spin-Lock Fields:  An Application to a Fyn SH3 Domain

2004· article· en· W2078070626 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueJournal of the American Chemical Society · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineChemistry
ThématiqueAdvanced NMR Techniques and Applications
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésChemistryMagnetizationAnisotropyChemical physicsNuclear magnetic resonanceMolecular physicsAnalytical Chemistry (journal)Magnetic fieldPhysicsOptics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

An (15)N NMR R(1rho) relaxation experiment is presented for the measurement of millisecond time scale exchange processes in proteins. On- and off-resonance R(1rho) relaxation profiles are recorded one residue at a time using a series of one-dimensional experiments in concert with selective Hartmann-Hahn polarization transfers. The experiment can be performed using low spin-lock field strengths (values as low as 25 Hz have been tested), with excellent alignment of magnetization along the effective field achieved. Additionally, suppression of the effects of cross-correlated relaxation between dipolar and chemical shift anisotropy interactions and (1)H-(15)N scalar coupled evolution is straightforward to implement, independent of the strength of the (15)N spin-locking field. The methodology is applied to study the folding of a G48M mutant of the Fyn SH3 domain that has been characterized previously by CPMG dispersion experiments. It is demonstrated through experiment that off-resonance R(1rho) data measured at a single magnetic field and one or more spin-lock field strengths, with amplitudes on the order of the rate of exchange, allow a complete characterization of a two-site exchange process. This is possible even in the case of slow exchange on the NMR time scale, where complementary approaches involving CPMG-based experiments fail. Advantages of this methodology in relation to other approaches are described.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,020
Score d'incertitude au seuil0,467

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,285
Écart entre enseignants0,277 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle