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Enregistrement W2078206807 · doi:10.1073/pnas.0501491102

E1A and a nuclear receptor corepressor splice variant (N-CoR <sub>I</sub> ) are thyroid hormone receptor coactivators that bind in the corepressor mode

2005· article· en· W2078206807 sur OpenAlexafffund
Xianwang Meng, Paul Webb, Yong-Fan Yang, Michael Shuen, Ahmed F. Yousef, John D. Baxter, Joe S. Mymryk, Paul G. Walfish

Notice bibliographique

RevueProceedings of the National Academy of Sciences · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueThyroid Disorders and Treatments
Établissements canadiensUniversity of TorontoMount Sinai HospitalWestern University
Organismes subventionnairesNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesCanadian Institutes of Health ResearchNational Institutes of Health
Mots-clésCorepressorNuclear receptorThyroid hormone receptorBiologyRepressorTranscription (linguistics)Transcription factorReceptorSmall heterodimer partnerCell biologyGeneMolecular biologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Unliganded thyroid hormone (TH) receptors (TRs) and other nuclear receptors (NRs) repress transcription of hormone-activated genes by recruiting corepressors (CoRs), such as NR CoR (N-CoR) and SMRT. Unliganded TRs also activate transcription of TH-repressed genes. Some evidence suggests that these effects also involve TR/CoR contacts; however, the precise reasons that CoRs activate transcription in these contexts are obscure. Unraveling these mechanisms is complicated by the fact that it is difficult to decipher direct vs. indirect effects of TR-coregulator contacts in mammalian cells. In this study, we used yeast, Saccharomyces cerevisiae, which lack endogenous NRs and NR coregulators, to determine how unliganded TRs can activate transcription. We previously showed that adenovirus 5 early-region 1A coactivates unliganded TRs in yeast, and that these effects are blocked by TH. We show here that human adenovirus type 5 early region 1A (E1A) contains a short peptide (LDQLIEEVL amino acids 20-28) that resembles CoR-NR interaction motifs (CoRNR boxes), and that this motif is required for TR binding and coactivation. Although full-length N-CoR does not coactivate TR in yeast, a naturally occurring N-CoR variant (N-CoR(I)) and an artificial N-CoR truncation (N-CoR(C)) that retain CoRNR boxes but lack N-terminal repressor domains behave as potent and direct TH-repressed coactivators for unliganded TRs. We conclude that E1A and N-CoR(I) are naturally occurring TR coactivators that bind in the typical CoR mode and suggest that similar factors could mediate transcriptional activation by unliganded TRs in mammals.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,031
Tête enseignante GPT0,283
Écart entre enseignants0,252 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations24
Publié2005
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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