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Enregistrement W2078279369 · doi:10.1139/b10-067

Two BTB proteins function redundantly as negative regulators of defense against pathogens in <i>Arabidopsis</i>

2010· article· en· W2078279369 sur OpenAlexaffvenue
Na Qu, Wenjian Gan, Dongling Bi, Shitou Xia, Xin Li, Yuelin Zhang

Notice bibliographique

RevueBotany · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueInsect-Plant Interactions and Control
Établissements canadiensCanada's Michael Smith Genome Sciences Centre
Organismes subventionnairesMinistry of Science and Technology of the People's Republic of China
Mots-clésBiologyOomyceteMutantJasmonic acidArabidopsisPathogenBotrytis cinereaCell biologyPlant defense against herbivoryGeneMicrobiologyBotanyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The BTB domain is a protein–protein interaction motif found throughout eukaryotes. Here we report the identification of two closely related BTB domain-containing proteins, POZ/BTB CONTAINING-PROTEIN 1 (POB1) and POB2, as negative regulators of defense against pathogens. In yeast two-hybrid assays, POB1 and POB2 dimerize through their BTB domains. The pob1–1 pob2–1 double mutant plants exhibited enhanced resistance against the fungal pathogen Botrytis cinerea and the oomycete pathogen Hyaloperonospora arabidopsidis Noco2. Double knockout, but not single mutants of pob1–1 and pob2–1, displayed enhanced sensitivity to growth inhibition by jasmonic acid (JA). In addition, expression of the JA-responsive defensin gene PDF1.2 is enhanced in the pob1–1 pob2–1 double mutant. Our data suggest that POB1 and POB2 function redundantly as negative regulators of JA-mediated pathogen resistance responses.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,207
Écart entre enseignants0,200 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations13
Publié2010
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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