Abstract P3-10-26: Quantitative Protein and Gene Expression Biomarkers of Tamoxifen and Letrozole Recurrence in the NCIC CTG MA.17 Cohort
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Background: The MA.17 study showed that extended adjuvant endocrine therapy with letrozole (LET) after completing 5 years of tamoxifen (TAM) markedly reduced the risk of recurrence in women with ER+ early stage breast cancer and improved overall survival in women presenting with node +ve disease. The HOXB 13:IL17BR gene expression ratio (signature) has been shown to predict outcome in breast cancer patients treated with adjuvant tamoxifen monotherapy and provides additional information beyond that from known positive (ER and PR) and negative (Her-1 and Her-2) predictors of responsiveness to tamoxifen in node-ve women. We report a case control evaluation of the Breast Cancer Index (BCI; bioTheranostics, Inc.), which combines the HOXB13 and IL17BR twogene and the molecular grade index (MGI) gene expression signatures, with respect to distinguishing which patients are at risk of late recurrences and who would respond to extended endocrine therapy with LET. The prognostic and predictive utility of quantitative immunofluorescence of ER, PR, Her-2, tumor aromatase, COX-2, GATA3 and Nat1 in the TAM-PLACEBO and the TAM-LET cohorts will also be evaluated and compared to results derived by standard immunohistochemistry. Methods: FFPE tumor blocks were collected from patients who experienced a breast cancer recurrence up to unblinding of MA.17. Controls were matched 2:1 for age, tumor size, lymph node status, and prior chemotherapy, and were all disease free for longer than cases. All cases were reviewed for standard histopathology by two independent pathologists. RNA was extracted, amplified, converted to cDNA and subjected to RT-PCR with primers and probes to HOXB13, IL17BR, BUB1A, CENPA, NEK2, RACGAP1 and RRM2. ER, PR HER1, HER2, COX2, Aromatase, GATA3 and NAT1 will be analyzed by routine IHC techniques and by immunoflourescent Automated Quantitative Analysis (AQuA). Results: 105 cases and 210 matched controls are available for evaluation. All sections are under review and tissue microarrays have been performed on all cases and controls. Detailed results on the BCI and ER, PR, Her-2 will be available at the SABCS. Discussion: MA.17 has shown that extended adjuvant endocrine therapy after tamoxifen is effective at preventing disease recurrence given for an additional 5 years. Numerous clinical trials are exploring whether extending AIs will show this benefit, and there is an increasing need to improve the therapeutic index by distinguishing those at risk from those who are not. It is also important to determine which patients will benefit from the therapy and which will recur without benefit. The latter patients could be triaged to clinical trials of novel therapies to overcome endocrine resistance. This study will help to define these issues and pave the way for more effective selection of specific patients for adjuvant endocrine strategies. Citation Information: Cancer Res 2010;70(24 Suppl):Abstract nr P3-10-26.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».