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Enregistrement W2078391732 · doi:10.1371/journal.pone.0020049

Diversity in the Reproductive Modes of European Daphnia pulicaria Deviates from the Geographical Parthenogenesis

2011· article· en· W2078391732 sur OpenAlexafffund
France Dufresne, Silvia Marková, Roland Vergilino, Marc Ventura, Petr Kotlı́k

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEvolution and Genetic Dynamics
Établissements canadiensUniversité du Québec à Rimouski
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaAkademie Věd České Republiky
Mots-clésBiologyParthenogenesisDaphnia pulexObligateLineage (genetic)ZoologyEcologyEvolutionary biologyDaphniaGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Multiple transitions to obligate parthenogenesis have occurred in the Daphnia pulex complex in North America. These newly formed asexual lineages are differentially distributed being found predominantly at high latitudes. This conforms to the rule of geographical parthenogenesis postulating prevalence of asexuals at high latitudes and altitudes. While the reproductive mode of high-latitude populations is relatively well studied, little is known about the reproduction mode in high altitudes. This study aimed to assess the reproductive mode of Daphnia pulicaria, a species of the D. pulex complex, from high altitude lakes in Europe. METHODOLOGY/PRINCIPAL FINDINGS: Variation at eight microsatellite loci revealed that D. pulicaria from the High Tatra Mountains (HTM) had low genotype richness and showed excess of heterozygotes and significant deviations from Hardy-Weinberg expectations, and was thus congruent with reproduction by obligate parthenogenesis. By contrast, populations from the Pyrenees (Pyr) were generally in Hardy-Weinberg equilibrium and had higher genotypic richness, suggesting that they are cyclic parthenogens. Four lakes from lowland areas (LLaP) had populations with an uncertain or mixed breeding mode. All D. pulicaria had mtDNA ND5 haplotypes of the European D. pulicaria lineage. Pyr were distinct from LLaP and HTM at the ND5 gene. By contrast, HTM shared two haplotypes with LLaP and one with Pyr. Principal Coordinate Analysis of the microsatellite data revealed clear genetic differentiation into three groups. HTM isolates were intermediate to Pyr and LLaP, congruent with a hybrid origin. CONCLUSION/SIGNIFICANCE: Inferred transitions to obligate parthenogenesis have occurred only in HTM, most likely as a result of hybridizations. In contrast to North American populations, these transitions do not appear to involve meiosis suppressor genes and have not been accompanied by polyploidy. The absence of obligate parthenogenesis in Pyr, an environment highly similar to the HTM, may be due to the lack of opportunities for hybridization.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,063
Tête enseignante GPT0,209
Écart entre enseignants0,146 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations24
Publié2011
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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