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Enregistrement W2078460274 · doi:10.1182/blood-2010-10-311415

A microRNA expression signature of osteoclastogenesis

2011· article· en· W2078460274 sur OpenAlexaff
Toshifumi Sugatani, Jean Vacher, Keith A. Hruska

Notice bibliographique

RevueBlood · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBone Metabolism and Diseases
Établissements canadiensMontreal Clinical Research Institute
Organismes subventionnairesNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney Diseases
Mots-clésmicroRNAGene expression profilingExpression (computer science)BiologyGene expressionMedicineComputational biologyGeneticsComputer scienceGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

MicroRNAs (miRs) are small noncoding RNAs that principally function in the spatiotemporal regulation of protein translation in animal cells. Although emerging evidence suggests that some miRs play important roles in osteoblastogenesis and skeletal homeostasis, much less is known in osteoclastogenesis. Here, we show that receptor activator of nuclear factor κB ligand (RANKL)-induced osteoclastogenesis is mediated by miR-21. MiR-21 was identified as an miR expression signature of RANKL-induced osteoclastogenesis that down-regulates programmed cell death 4 (PDCD4) protein levels. Diminished PDCD4 removes a repression from c-Fos, a critical transcription factor for osteoclastogenesis and osteoclast-specific downstream target genes. In addition, RANKL-induced c-Fos up-regulates miR-21 gene expression. Bone marrow-derived monocyte/macrophage precursors deficient of DiGeorge syndrome critical region gene 8, an RNA binding protein associated with miR biogenesis, and Dicer, an endoribonuclease in the RNaseIII family associated with miR biogenesis, possessed significantly decreased miR-21 levels and increased PDCD4 protein levels so that RANKL-induced osteoclastogenesis was impaired in those cells. However, forced expression of miR-21 rescued osteoclast development because of down-regulation of PDCD4 protein expression levels. Thus, our studies provide a new molecular mechanism, including a positive feedback loop of c-Fos/miR-21/PDCD4, regulating osteoclastogenesis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,202
Écart entre enseignants0,192 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations274
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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