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Enregistrement W2078594049 · doi:10.2174/157340910791760064

Applications of Current Proteomics Techniques in Modern Drug Design

2010· review· en· W2078594049 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueCurrent Computer - Aided Drug Design · 2010
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetics, Bioinformatics, and Biomedical Research
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésProteomicsPhosphoproteomicsDrugComputational biologyDrug discoveryDrug targetDrug developmentQuantitative proteomicsMechanism (biology)Identification (biology)Drug actionComputer scienceBioinformaticsBiologyProtein phosphorylationPhosphorylationPharmacologyProtein kinase ACell biologyBiochemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Proteins are currently the major drug targets and thus play a critical role in the process of modern drug design. This typically involves construction of drug compounds based on the structure of a drug target, validation for therapeutic efficacy of the drug compounds, evaluation of drug toxicity, and finally, clinical trial. Proteomics, defined as the comprehensive analysis of the proteins that are expressed in cells or tissues, can be employed at different stages of this process. Comparative proteomics can distinguish subtle changes in protein abundance at a depth of several thousand proteins at different conditions i.e. normal vs disease, to facilitate drug target identification. Also, chemical proteomics can be used to determine drug-target interactions and systematically analyze drug specificity and selectivity. Moreover, phosphoproteomics can be employed to monitor changes in phosphorylation events to characterize drug actions on cell signaling pathways. Similarly, functional proteomics can be utilized to investigate protein-protein and protein-ligand interactions for the clarification of the mechanism of drug action, identification of disease-related sub-networks and novel drug targets. Furthermore, quantitative proteomics can be used to characterize long-term drug effects on protein expression. In addition, computational approaches have emerged to convert complex proteomic data into sophisticated computer models of cellular protein networks. In this review, we will provide an overview of these state-of-the-art proteomics techniques, describe their underlying experimental concepts and compare them to each other, and discuss existing and future applications in the art of drug design and development.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,986
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,068
Tête enseignante GPT0,362
Écart entre enseignants0,294 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle