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Enregistrement W2078607802 · doi:10.1128/aac.04490-14

Vancomycin-Variable Enterococci Can Give Rise to Constitutive Resistance during Antibiotic Therapy

2014· article· en· W2078607802 sur OpenAlexafffund
Maulik Thaker, Lindsay Kalan, Nicholas Waglechner, Alireza Eshaghi, Samir N. Patel, Susan M. Poutanen, Barbara Willey, Bryan Coburn, Allison McGeer, Donald E. Low, Gerard D. Wright

Notice bibliographique

RevueAntimicrobial Agents and Chemotherapy · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAntimicrobial Resistance in Staphylococcus
Établissements canadiensUniversity Health NetworkMount Sinai HospitalUniversity of TorontoPublic Health OntarioMcMaster University
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésVancomycinBiologyEnterococcusMicrobiologyAntibioticsDrug resistanceGlycopeptide antibioticAntibiotic resistanceGlycopeptideBacteriaGeneticsStaphylococcus aureus

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Vancomycin-resistant enterococci (VRE) are notorious clinical pathogens restricting the use of glycopeptide antibiotics in the clinic setting. Routine surveillance to detect VRE isolated from patients relies on PCR bioassays and chromogenic agar-based test methods. In recent years, we and others have reported the emergence of enterococcal strains harboring a "silent" copy of vancomycin resistance genes that confer a vancomycin-susceptible phenotype (vancomycin-susceptible enterococci [VSE]) and thus escape detection using drug sensitivity screening tests. Alarmingly, these strains are able to convert to a resistance phenotype (VSE→VRE) during antibiotic treatment, severely compromising the success of therapy. Such strains have been termed vancomycin-variable enterococci (VVE). We have investigated the molecular mechanisms leading to the restoration of resistance in VVE isolates through the whole-genome sequencing of resistant isolates, measurement of resistance gene expression, and quantification of the accumulation of drug-resistant peptidoglycan precursors. The results demonstrate that VVE strains can revert to a VRE phenotype through the constitutive expression of the vancomycin resistance cassette. This is accomplished through a variety of changes in the DNA region upstream of the resistance genes that includes both a deletion of a likely transcription inhibitory secondary structure and the introduction of a new unregulated promoter. The VSE→VRE transition of VVE can occur in patients during the course of antibiotic therapy, resulting in treatment failure. These VVE strains therefore pose a new challenge to the current regimen of diagnostic tests used for VRE detection in the clinic setting.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,248
Écart entre enseignants0,238 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations66
Publié2014
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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