Human Pax-5 C-terminal Isoforms Possess Distinct Transactivation Properties and Are Differentially Modulated in Normal and Malignant B Cells
Notice bibliographique
Résumé
The transcription factor Pax-5 occupies a central role in B cell differentiation and has been implicated in the development of B cell lymphoma. The transcriptional activation function of Pax-5 requires an intact N-terminal DNA-binding domain and is strongly influenced by the C-terminal transactivation domain. We report the identification and characterization of five human Pax-5 isoforms, which occur through the alternative splicing of exons that encode for the C-terminal transactivation domain. These isoforms arise from the inclusion or exclusion of exon 7, exon 8, and/or exon 9. Three of the Pax-5 isoforms generate novel protein sequences rich in proline, serine, and threonine amino acids that are the hallmarks of transactivation domains. The Pax-5 isoforms are expressed in peripheral blood mononuclear cells, cancerous and non-cancerous B cell lines, as well as in primary B cell lymphoma tissue. Electrophoretic mobility shift assays demonstrate that the isoforms possess specific DNA binding activity and recognize the PAX-5 consensus binding sites. In reporter assays using the CD19 promoter, the transactivation properties of the various isoforms were significantly influenced by the changes in the C-terminal protein sequence. Finally, we demonstrate, for the first time, that human Pax-5 isoform expression is modulated by specific signaling pathways in B lymphocytes.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».