No evidence of linkage to chromosome 1q42.2–43 in 131 prostate cancer families from the ACTANE Consortium
Notice bibliographique
Résumé
Genetic linkage studies worldwide have proposed various chromosomal localizations for prostate cancer susceptibility genes. A recent study found evidence for linkage to chromosome 1q42.2-43. The aim of our study was to attempt to confirm these findings by performing linkage analysis in 131 families with multiple prostate cancer cases selected from the ACTANE (Anglo, Canada, Texas, Australia, Norway, EU Biomed) Consortium. Parametric and non-parametric linkage (NPL) analyses were performed. Two-point LOD scores failed to show evidence of linkage at any marker (maximum two-point LOD score = 0. 40 at recombination fraction theta = 0.2 with marker D1S2850). Using a multipoint heterogeneity analysis, the estimated proportion of families linked to this putative locus (alpha) was 0% (95% CI = 0. 00-0.33). Non-parametric linkage analysis also found no evidence of linkage (maximum NPL score = -0.12, P = 0.55). This analysis of 131 ACTANE families does not support the presence of a locus for a prostate cancer susceptibility gene at 1q42.2-43. Although we cannot rule out the existence of such a locus, analysis indicates that less than 16% of families could be linked to this region. These findings may be a reflection of the locus heterogeneity involved in this disease indicating that there are still other major susceptibility loci to be identified.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,006 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,006 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».