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Enregistrement W2078990787 · doi:10.1111/jeb.12396

The founding of <scp>M</scp>auritian endemic coffee trees by a synchronous long‐distance dispersal event

2014· article· en· W2078990787 sur OpenAlexaff
Michael Nowak, Benjamin C. Haller, Anne D. Yoder

Notice bibliographique

RevueJournal of Evolutionary Biology · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant and animal studies
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesAgence Nationale de la Recherche
Mots-clésBiologyBiological dispersalColonizationPopulationPhylogenetic treeAlleleFounder effectOutcrossingEcologyEvolutionary biologyGeneticsGeneDemographyHaplotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The stochastic process of long-distance dispersal is the exclusive means by which plants colonize oceanic islands. Baker's rule posits that self-incompatible plant lineages are unlikely to successfully colonize oceanic islands because they must achieve a coordinated long-distance dispersal of sufficiently numerous individuals to establish an outcrossing founder population. Here, we show for the first time that Mauritian Coffea species are self-incompatible and thus represent an exception to Baker's rule. The genus Coffea (Rubiaceae) is composed of approximately 124 species with a paleotropical distribution. Phylogenetic evidence strongly supports a single colonization of the oceanic island of Mauritius from either Madagascar or Africa. We employ Bayesian divergence time analyses to show that the colonization of Mauritius was not a recent event. We genotype S-RNase alleles from Mauritian endemic Coffea, and using S-allele gene genealogies, we show that the Mauritian allelic diversity is confined to just seven deeply divergent Coffea S-RNase allelic lineages. Based on these data, we developed an individual-based model and performed a simulation study to estimate the most likely number of founding individuals involved in the colonization of Mauritius. Our simulations show that to explain the observed S-RNase allelic diversity, the founding population was likely composed of fewer than 31 seeds that were likely synchronously dispersed from an ancestral mainland species.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,437
Score d'incertitude au seuil0,246

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,219
Écart entre enseignants0,205 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations13
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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