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Enregistrement W2079001769 · doi:10.1177/00220345000790031001

Mass Spectrometry of Native Rat Amelogenins: Primary Transcripts, Secretory Isoforms, and C-terminal Degradation

2000· article· en· W2079001769 sur OpenAlexaff
W.-Y. Chen, A.W. Bell, James P. Simmer, C E Smith

Notice bibliographique

RevueJournal of Dental Research · 2000
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueBone and Dental Protein Studies
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAmelogeninChemistryGene isoformMolecular massAmeloblastBiochemistryElectrospray ionizationGel electrophoresisMass spectrometryProteolysisMolecular biologyCleavage (geology)ChromatographyEnamel paintEnzymeBiologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Cloning technologies have established unambiguously that amelogenins always seem larger in molecular weight (Mr) by gel electrophoresis (SDS-PAGE) than by mass spectrometry (MS). This has caused many problems relating cloned versions of amelogenin to proteins actually secreted by ameloblasts in vivo. In this study, discrete protein fractions at 31-20 kDa (Mr(SDS)) were prepared from freeze-dried rat incisor enamel by techniques optimized for preserving protein integrity. N-terminal sequence and amino acid compositional analyses indicated that the major protein forming these fractions was amelogenin. As expected, the molecular weights estimated by matrix-assisted laser desorption ionization (MALDI) and electrospray ionization (ESI) MS were significantly less than their apparent molecular weights estimated by SDS-PAGE. Plots of Mr(SDS) vs. Mr(MS) for all fractions showed high linear correlation (r = 0.992). Analysis of MS data further indicated that the major protein in the 27-kDa fraction corresponded to the R180 secretory isoform of rat amelogenin, whereas some minor proteins in the 23-kDa fraction likely corresponded to a R156 secretory isoform. This was in contrast to major proteins forming the 25-, 24-, and 23-kDa fractions (Mr(SDS)), which seemed to represent proteolytic fragments of R180 progressively altered at the P169-A170, P164-L165, and F151-S152 C-terminal cleavage sites, respectively. Proteins in the 20-kDa fraction (Mr(SDS)) most closely matched by ESI-MS fragments of the R156 secretory isoform that were C-terminally-modified at the equivalent P164-L165 site.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,505
Score d'incertitude au seuil0,350

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,051
Tête enseignante GPT0,356
Écart entre enseignants0,305 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations15
Publié2000
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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