Mass Spectrometry of Native Rat Amelogenins: Primary Transcripts, Secretory Isoforms, and C-terminal Degradation
Notice bibliographique
Résumé
Cloning technologies have established unambiguously that amelogenins always seem larger in molecular weight (Mr) by gel electrophoresis (SDS-PAGE) than by mass spectrometry (MS). This has caused many problems relating cloned versions of amelogenin to proteins actually secreted by ameloblasts in vivo. In this study, discrete protein fractions at 31-20 kDa (Mr(SDS)) were prepared from freeze-dried rat incisor enamel by techniques optimized for preserving protein integrity. N-terminal sequence and amino acid compositional analyses indicated that the major protein forming these fractions was amelogenin. As expected, the molecular weights estimated by matrix-assisted laser desorption ionization (MALDI) and electrospray ionization (ESI) MS were significantly less than their apparent molecular weights estimated by SDS-PAGE. Plots of Mr(SDS) vs. Mr(MS) for all fractions showed high linear correlation (r = 0.992). Analysis of MS data further indicated that the major protein in the 27-kDa fraction corresponded to the R180 secretory isoform of rat amelogenin, whereas some minor proteins in the 23-kDa fraction likely corresponded to a R156 secretory isoform. This was in contrast to major proteins forming the 25-, 24-, and 23-kDa fractions (Mr(SDS)), which seemed to represent proteolytic fragments of R180 progressively altered at the P169-A170, P164-L165, and F151-S152 C-terminal cleavage sites, respectively. Proteins in the 20-kDa fraction (Mr(SDS)) most closely matched by ESI-MS fragments of the R156 secretory isoform that were C-terminally-modified at the equivalent P164-L165 site.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».