Identification of α-tubulin as a granzyme B substrate during CTL-mediated apoptosis
Notice bibliographique
Résumé
Cytotoxic lymphocytes induce target cell apoptosis via two major pathways: Fas/FasL and granule exocytosis. The latter pathway has largely been defined by the roles of the pore-forming protein perforin and by the serine proteinases granzymes A and B. Upon entry into target cells, the granzymes cleave substrates that ultimately result in cell death. To gain further insight into granzyme B function, we have identified novel substrates. SDS-PAGE analysis of S100 cell lysates identified a 51 kDa protein that was cleaved by granzyme B. Mass spectrometry analysis revealed that this fragment was the microtubule protein, alpha-tubulin, which was confirmed by western blotting. In addition, two-dimensional gel analysis showed that the truncated form of alpha-tubulin had a more basic isoelectric point than the full-length molecule, suggesting that granzyme B removed the acidic C-terminus. Site-directed mutagenesis within this region of alpha-tubulin revealed the granzyme B recognition site, which is conserved in a subset of alpha-tubulin isoforms. Significantly, we showed that alpha-tubulin was cleaved in target cells undergoing apoptosis as induced by cytotoxic T lymphocytes. Therefore, in addition to its role in the activation of mitochondria during apoptosis, these results suggest a role for granzyme B in the dismantling of the cytoskeleton.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».