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Enregistrement W2079139732 · doi:10.1039/c0ob00826e

Probing the acceptor substrate binding site of Trypanosoma cruzi trans-sialidase with systematically modified substrates and glycoside libraries

2011· article· en· W2079139732 sur OpenAlexaff
J.A. Harrison, K. P. Ravindranathan Kartha, E Fournier, Todd L. Lowary, Carles Malet, Ulf J. Nilsson, Ole Hindsgaul, Sérgio Schenkman, James H. Naismith, Robert A. Field

Notice bibliographique

RevueOrganic & Biomolecular Chemistry · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueTrypanosoma species research and implications
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesBiotechnology and Biological Sciences Research CouncilWellcome Trust
Mots-clésGalactoseContext (archaeology)ChemistryGalactosidesStereochemistryBinding siteBiochemistryAcceptorResidue (chemistry)Substrate (aquarium)Sialic acidBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Systematically modified octyl galactosides and octyl N-acetyllactosamines were assessed as inhibitors of, and substrates for, T. cruzi trans-sialidase (TcTS) in the context of exploring its acceptor substrate binding site. These studies show that TcTS, which catalyses the α-(2→3)-sialylation of non-reducing terminal β-galactose residues, is largely intolerant of substitution of the galactose 2 and 4 positions whereas substitution of the galactose 6 position is well tolerated. Further studies show that even the addition of a bulky sugar residue (glucose, galactose) does not impact negatively on TcTS binding and turnover, which highlights the potential of 'internal' 6-substituted galactose residues to serve as TcTS acceptor substrates. Results from screening a 93-membered thiogalactoside library highlight a number of structural features (notably imidazoles and indoles) that are worthy of further investigation in the context of TcTS inhibitor development.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,012
Score d'incertitude au seuil0,654

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,236
Écart entre enseignants0,212 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations32
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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