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Enregistrement W2079148884 · doi:10.1186/1471-2172-10-30

Efficient isolation of highly purified tonsil B lymphocytes using RosetteSep with allogeneic human red blood cells

2009· article· en· W2079148884 sur OpenAlexafffund
Jonathan Zuccolo, Tammy L. Unruh, Julie P. Deans

Notice bibliographique

RevueBMC Immunology · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueBlood groups and transfusion
Établissements canadiensInstitute of Infection and ImmunityUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchUniversity of Calgary
Mots-clésTonsilPeripheral blood mononuclear cellRed blood cellWhole bloodImmunologyBiologyBlood cellMolecular biologyChemistryIn vitroBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Human tonsils are a rich source of B lymphocytes exhibiting a variety of phenotypes and activation states. Existing methods of purification are time consuming or costly. The aim of the present study was to optimize conditions to isolate large numbers of highly purified primary B lymphocytes from tonsils in a short and cost-effective single step, using a commercially available reagent designed for purifying cells from whole blood (RosetteSep). This technique relies on the presence of the large excess of red blood cells in whole blood for the formation of immunorosettes, whereas single cell suspensions from tonsils contain relatively few red blood cells. RESULTS: B cell enrichment from tonsils was achieved using RosetteSep with no modification to the whole blood procedure; however, the degree of purity depended on the extent of red blood cell contamination of the starting tonsil cell suspension. Addition of a 50-fold excess of allogeneic human red blood cells, but not sheep red blood cells, reproducibly resulted in high levels of purity. Depletion of mononuclear cells from the donor red blood cells eliminated potential contamination with allogeneic B cells. CONCLUSION: RosetteSep reagent can be used in combination with allogeneic human red blood cells to reproducibly isolate tonsil B lymphocytes to high levels of purity with no change in phenotype or loss of cells. This method provides considerable time and cost savings compared to other methods.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,244
Écart entre enseignants0,229 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations14
Publié2009
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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