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Enregistrement W2079150412 · doi:10.1152/japplphysiol.00695.2004

Cloning and sequencing of myosin heavy chain isoform cDNAs in golden-mantled ground squirrels: effects of hibernation on mRNA expression

2004· article· en· W2079150412 sur OpenAlexfundno aff
Bryan C. Rourke, Anqi Qin, Fadia Haddad, Kenneth M. Baldwin, Vincent J. Caiozzo

Notice bibliographique

RevueJournal of Applied Physiology · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAdipose Tissue and Metabolism
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute of Arthritis and Musculoskeletal and Skin DiseasesUniversity of British Columbia
Mots-clésComplementary DNABiologyMyosinGene isoformGround squirrelMessenger RNAMolecular biologyTorporGene expressionUntranslated regionCell biologyGeneticsGeneEndocrinologyAnatomySquirrel monkeyThermoregulation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The golden-mantled ground squirrel is a small rodent hibernator that demonstrates unusual myosin heavy chain (MHC) isoform plasticity during several months of torpor, punctuated by bouts of rewarming and shivering thermogenesis. We measured MHC mRNA levels to determine whether pretranslational control mechanisms were responsible for differences in MHC2x protein expression, as we previously observed between active and hibernating ground squirrels. We first cloned cDNA using the 3' rapid amplification of cDNA ends (3' RACE) technique and identified three sequences corresponding to MHC1, MHC2x, and MHC2b. A DNA control fragment was developed to be used in conjunction with a coupled RT-PCR reaction to simultaneously measure MHC mRNA levels for each isoform in the skeletal muscle of ground squirrels. MHC mRNA and protein expression were strongly correlated, and type IIx and IIb mRNA levels were significantly different between active and hibernating ground squirrels. Pretranslational control of MHC protein is apparently an important process during hibernation, although the exact stimulus is not known. The techniques presented can be used to obtain MHC cDNA sequences and to measure mRNA expression in many vertebrate groups.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,259
Écart entre enseignants0,248 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations21
Publié2004
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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