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Enregistrement W2079248879 · doi:10.1002/ajmg.a.35979

Detection of rarely identified multiple mutations in <i>MECP2</i> gene do not contribute to enhanced severity in rett syndrome

2013· article· en· W2079248879 sur OpenAlexaff
Christopher A. Chapleau, Jane B. Lane, Susan M. Kirwin, Carolyn Schanen, Kathy M. B. Vinette, Danielle Stubbolo, Patrick MacLeod, Alan K. Percy

Notice bibliographique

RevueAmerican Journal of Medical Genetics Part A · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetics and Neurodevelopmental Disorders
Établissements canadiensVictoria General Hospital
Organismes subventionnairesEunice Kennedy Shriver National Institute of Child Health and Human DevelopmentNational Institutes of HealthIntellectual and Developmental Disabilities Research CenterRare Diseases Clinical Research Network
Mots-clésRett syndromeMECP2MutationGeneticsGeneGene mutationCohortAlleleDiseaseMedicineBiologyBioinformaticsInternal medicinePhenotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The objective of our study was to characterize the influence of multiple mutations in the MECP2 gene in a cohort of individuals with Rett syndrome. Further analysis demonstrated that nearly all resulted from de novo in cis mutations, where the disease severity was indistinguishable from single mutations. Our methods involved enrolling participants in the RTT Natural History Study (NHS). After providing informed consent through their parents or principal caretakers, additional molecular assessments were performed in the participants and their parents to assess the presence and location of more than one mutation in each. Clinical severity was assessed at each visit in those participants in the NHS. Non-contiguous MECP2 gene variations were detected in 12 participants and contiguous mutations involving a deletion and insertion in three participants. Thirteen of 15 participants had mutations that were in cis; four (of 13) had three MECP2 mutations; two (of 15) had mutations that were both in cis and in trans (i.e., on different alleles). Clinical severity did not appear different from NHS participants with a single similar mutation. Mutations in cis were identified in most participants; two individuals had mutations both in cis and in trans. The presence of multiple mutations was not associated with greater severity. Nevertheless, multiple mutations will require greater thought in the future, if genetic assignment to drug treatment protocols is considered.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,005
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,005
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,246
Écart entre enseignants0,238 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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