MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2079260453 · doi:10.1099/mic.0.28692-0

Phosphoethanolamine substitution in the lipid A of Escherichia coli O157 : H7 and its association with PmrC

2006· article· en· W2079260453 sur OpenAlexafffund
Sang-Hyun Kim, Wenyi Jia, Valeria R. Parreira, Russell E. Bishop, Carlton Gyles

Notice bibliographique

RevueMicrobiology · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueSalmonella and Campylobacter epidemiology
Établissements canadiensUniversity of GuelphCanada Research ChairsUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésEscherichia coliLipid APlasmidLipid metabolismBiochemistryChemistryBiologyEnterobacteriaceaePeptideBacteriaGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

This study shows that lipid A of Escherichia coli O157 : H7 differs from that of E. coli K-12 in that it has a phosphoform at the C-1 position, which is distinctively modified by a phosphoethanolamine (PEtN) moiety, in addition to the diphosphoryl form. The pmrC gene responsible for the addition of PEtN to the lipid A of E. coli O157 : H7 was inactivated and the changes in lipid A profiles were assessed. The pmrC null mutant still produced PEtN-modified lipid A species, albeit in a reduced amount, indicating that PmrC was not the only enzyme that could be used to add PEtN to lipid A. Natural PEtN substitution was shown to be present in the lipid A of other serotypes of enterohaemorrhagic E. coli and absent from the lipid A of E. coli K-12. However, the cloned pmrC(O157) gene in a high-copy-number plasmid generated a large amount of PEtN-substituted lipid A species in E. coli K-12. The occurrence of PEtN-substituted lipid A species was associated with a slight increase in the MICs of cationic peptide antibiotics, suggesting that the lipid A modification with PEtN would be beneficial for survival of E. coli O157 : H7 in certain environmental niches. However, PEtN substitution in the lipid A profiles was not detected when putative inner-membrane proteins (YhbX/YbiP/YijP/Ecf3) that show significant similarity with PmrC in amino acid sequence were expressed from high-copy-number plasmids in E. coli K-12. This suggests that these potential homologues are not responsible for the addition of PEtN to lipid A in the pmrC mutant of E. coli O157 : H7. When cells were treated with EDTA, the amount of palmitoylated lipid A from the cells carrying a high-copy-number plasmid clone of pmrC(O157) that resulted in significant increase of PEtN substitution was unchanged compared with cells without PEtN substitution, suggesting that the PEtN moiety substituted in lipid A does not compensate for the loss of divalent cations required for bridging neighbouring lipid A molecules.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,805
Score d'incertitude au seuil0,123

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,193
Écart entre enseignants0,183 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations53
Publié2006
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueMicrobiologyMême sujetSalmonella and Campylobacter epidemiologyTravaux en français237 207