Genetic consequences of postglacial colonization by the endemic Yarkand hare (Lepus yarkandensis) of the arid Tarim Basin
Notice bibliographique
Résumé
Orogenesis of the Qinghai-Tibetan Plateau, which occurred in a stepwise manner, contributed to the extreme aridity of the Tarim Basin, resulting in vulnerable and unstable ecosystems. Quaternary climatic oscillations may have affected the ecosystems and, consequently, the distributions and genetic structuring of the Tarim Basin’s biota. We used nucleotide sequence data from 2 mitochondrial (mt) DNA genes (Cyt b and the D-loop) to test hypotheses associated with the matrilineal and demographical histories of the Tarim Basin’s endemic Yarkand hare ( Lepus yarkandensis ). Range-wide sampling involving 20 populations and 224 individuals detected 126 haplotypes that clustered into 5 major lineages in both the phylogenetic tree and median-joining network. Populations from the northern and eastern Tarim Basin shared a similar history, as did those from the western and southern regions. Demographical analysis and genetic diversity estimations suggested that the western and southern regions might have served as glacial refugia for the Yarkand hare during Quaternary climatic oscillations. The distribution of the Yarkand hare, especially in the northern and eastern parts, probably represented 3 postglacial colonization events, dated to 0.21, 0.090 and 0.054 MYA, which corresponded to known interglacial periods. Given the relatively complete geographic isolation between the eastern and southern populations, the Yarkand hare likely dispersed during postglacial periods from the southwest to the north, and then onward to the east. The absence of water likely forced the species into refugia, and this differed from other Pleistocene biogeographical drivers. The demographical and historical patterns have important implications for conservation.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».