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Enregistrement W2079478580 · doi:10.1074/jbc.m705466200

Sequences in Intron 51 of the von Willebrand Factor Gene Target Promoter Activation to a Subset of Lung Endothelial Cells in Transgenic Mice

2007· article· en· W2079478580 sur OpenAlexaff
Ann M. Kleinschmidt, Marjan Nassiri, Karla Wasserloos, Simon C. Watkins, Bruce R. Pitt, Nadia Jahroudi

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer-related gene regulation
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesNational Heart, Lung, and Blood Institute
Mots-clésIntronMolecular biologyBiologyPromoterGeneExonTransgeneGene expressionTransfectionGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In vivo analyses of the VWF promoter previously demonstrated that a fragment spanning sequences -487 to +247 targets promoter activation to brain vascular endothelial cells, whereas a longer fragment including 2182 bp of the 5'-flanking sequences, the first exon, and the first intron activated expression in endothelial cells of the heart and muscles as well as the brain of transgenic mice. These results suggested that additional VWF gene sequences were required for expression in other vascular endothelial cells in vivo. We have now identified a region within intron 51 of the VWF gene that is DNase I-hypersensitive (HSS) specifically in non-endothelial cells and interacts with endothelial and non-endothelial specific complexes that contain YY1. We demonstrate that beta-actin is associated with YY1 specifically in the nucleus of non-endothelial cells and is a component of the nuclear protein complexes that interact with the DNase I-hypersensitive region. In vitro transfection analyses demonstrated that HSS sequences containing this YY1-binding site do not significantly affect VWF promoter activity. However, in vivo analyses demonstrated that addition of these sequences to the VWF promoter (-487 to +247) results in promoter activation in lung and brain vascular endothelial cells. These results demonstrate that the HSS sequences in intron 51 of the VWF gene contain cis-acting elements that are necessary for the VWF gene transcription in a subset of lung endothelial cells in vivo.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,015
Score d'incertitude au seuil0,290

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,243
Écart entre enseignants0,233 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations20
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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