A method for encoding clinical datasets with SNOMED CT
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Over the past decade there has been a growing body of literature on how the Systematised Nomenclature of Medicine Clinical Terms (SNOMED CT) can be implemented and used in different clinical settings. Yet, for those charged with incorporating SNOMED CT into their organisation's clinical applications and vocabulary systems, there are few detailed encoding instructions and examples available to show how this can be done and the issues involved. This paper describes a heuristic method that can be used to encode clinical terms in SNOMED CT and an illustration of how it was applied to encode an existing palliative care dataset. METHODS: The encoding process involves: identifying input data items; cleaning the data items; encoding the cleaned data items; and exporting the encoded terms as output term sets. Four outputs are produced: the SNOMED CT reference set; interface terminology set; SNOMED CT extension set and unencodeable term set. RESULTS: The original palliative care database contained 211 data elements, 145 coded values and 37,248 free text values. We were able to encode ~84% of the terms, another ~8% require further encoding and verification while terms that had a frequency of fewer than five were not encoded (~7%). CONCLUSIONS: From the pilot, it would seem our SNOMED CT encoding method has the potential to become a general purpose terminology encoding approach that can be used in different clinical systems.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,003 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle